Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Mdc1Q5PSV9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Mdc1Q5PSV9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Mdc1Q5PSV9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Mdc1Q5PSV9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Mdc1Q5PSV9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Mdc1Q5PSV9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Mdc1Q5PSV9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Mdc1Q5PSV9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Mdc1Q5PSV9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Mdc1Q5PSV9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Mdc1Q5PSV9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Mdc1Q5PSV9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Mdc1Q5PSV9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Mdc1Q5PSV9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Mdc1Q5PSV9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Mdc1Q5PSV9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Mdc1Q5PSV9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
Mdc1Q5PSV9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Mdc1Q5PSV9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Mdc1Q5PSV9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Mdc1Q5PSV9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Mdc1Q5PSV9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Mdc1Q5PSV9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Mdc1Q5PSV9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Mdc1Q5PSV9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Mdc1Q5PSV9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Mdc1Q5PSV9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Mdc1Q5PSV9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Mdc1Q5PSV9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Mdc1Q5PSV9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Mdc1Q5PSV9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Mdc1Q5PSV9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Mdc1Q5PSV9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Mdc1Q5PSV9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Mdc1Q5PSV9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Mdc1Q5PSV9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Mdc1Q5PSV9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Mdc1Q5PSV9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Mdc1Q5PSV9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Mdc1Q5PSV9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Mdc1Q5PSV9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Mdc1Q5PSV9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Mdc1Q5PSV9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Mdc1Q5PSV9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Mdc1Q5PSV9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Mdc1Q5PSV9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Mdc1Q5PSV9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Mdc1Q5PSV9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Mdc1Q5PSV9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Mdc1Q5PSV9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Mdc1Q5PSV9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Mdc1Q5PSV9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Mdc1Q5PSV9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Mdc1Q5PSV9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Mdc1Q5PSV9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Mdc1Q5PSV9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Mdc1Q5PSV9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Mdc1Q5PSV9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Mdc1Q5PSV9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Mdc1Q5PSV9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Mdc1Q5PSV9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Mdc1Q5PSV9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Mdc1Q5PSV9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Mdc1Q5PSV9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Mdc1Q5PSV9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Mdc1Q5PSV9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Mdc1Q5PSV9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Mdc1Q5PSV9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Mdc1Q5PSV9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Mdc1Q5PSV9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Mdc1Q5PSV9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Mdc1Q5PSV9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Mdc1Q5PSV9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Mdc1Q5PSV9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Mdc1Q5PSV9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Mdc1Q5PSV9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
Mdc1Q5PSV9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Mdc1Q5PSV9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Mdc1Q5PSV9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Mdc1Q5PSV9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
Mdc1Q5PSV9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Mdc1Q5PSV9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Mdc1Q5PSV9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Mdc1Q5PSV9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Mdc1Q5PSV9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Mdc1Q5PSV9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Mdc1Q5PSV9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Mdc1Q5PSV9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Mdc1Q5PSV9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Mdc1Q5PSV9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC31.95■■■□□ 2.7
Mdc1Q5PSV9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Mdc1Q5PSV9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Mdc1Q5PSV9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Mdc1Q5PSV9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Mdc1Q5PSV9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Mdc1Q5PSV9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Mdc1Q5PSV9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
Mdc1Q5PSV9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Mdc1Q5PSV9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms