Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCY0

Kdm6b, Lysine-specific demethylase 6B, mousemouse

Predictions only

Length 1,641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm6bQ5NCY0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Kdm6bQ5NCY0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Kdm6bQ5NCY0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Kdm6bQ5NCY0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Kdm6bQ5NCY0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Kdm6bQ5NCY0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Kdm6bQ5NCY0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Kdm6bQ5NCY0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
Kdm6bQ5NCY0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Kdm6bQ5NCY0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
Kdm6bQ5NCY0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Kdm6bQ5NCY0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Kdm6bQ5NCY0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Kdm6bQ5NCY0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Kdm6bQ5NCY0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
Kdm6bQ5NCY0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
Kdm6bQ5NCY0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Kdm6bQ5NCY0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
Kdm6bQ5NCY0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
Kdm6bQ5NCY0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Kdm6bQ5NCY0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Kdm6bQ5NCY0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Kdm6bQ5NCY0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Kdm6bQ5NCY0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Kdm6bQ5NCY0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
Kdm6bQ5NCY0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
Kdm6bQ5NCY0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
Kdm6bQ5NCY0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Kdm6bQ5NCY0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Kdm6bQ5NCY0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Kdm6bQ5NCY0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Kdm6bQ5NCY0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Kdm6bQ5NCY0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Kdm6bQ5NCY0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Kdm6bQ5NCY0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
Kdm6bQ5NCY0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Kdm6bQ5NCY0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Kdm6bQ5NCY0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Kdm6bQ5NCY0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Kdm6bQ5NCY0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Kdm6bQ5NCY0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Kdm6bQ5NCY0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Kdm6bQ5NCY0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Kdm6bQ5NCY0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Kdm6bQ5NCY0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Kdm6bQ5NCY0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
Kdm6bQ5NCY0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Kdm6bQ5NCY0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Kdm6bQ5NCY0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Kdm6bQ5NCY0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Kdm6bQ5NCY0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Kdm6bQ5NCY0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Kdm6bQ5NCY0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Kdm6bQ5NCY0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Kdm6bQ5NCY0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Kdm6bQ5NCY0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Kdm6bQ5NCY0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Kdm6bQ5NCY0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Kdm6bQ5NCY0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Kdm6bQ5NCY0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Kdm6bQ5NCY0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
Kdm6bQ5NCY0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
Kdm6bQ5NCY0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Kdm6bQ5NCY0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Kdm6bQ5NCY0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Kdm6bQ5NCY0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
Kdm6bQ5NCY0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Kdm6bQ5NCY0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Kdm6bQ5NCY0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
Kdm6bQ5NCY0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Kdm6bQ5NCY0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Kdm6bQ5NCY0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Kdm6bQ5NCY0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
Kdm6bQ5NCY0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Kdm6bQ5NCY0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Kdm6bQ5NCY0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
Kdm6bQ5NCY0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Kdm6bQ5NCY0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Kdm6bQ5NCY0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Kdm6bQ5NCY0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Kdm6bQ5NCY0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Kdm6bQ5NCY0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Kdm6bQ5NCY0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Kdm6bQ5NCY0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Kdm6bQ5NCY0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Kdm6bQ5NCY0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Kdm6bQ5NCY0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Kdm6bQ5NCY0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Kdm6bQ5NCY0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Kdm6bQ5NCY0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Kdm6bQ5NCY0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Kdm6bQ5NCY0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
Kdm6bQ5NCY0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
Kdm6bQ5NCY0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Kdm6bQ5NCY0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Kdm6bQ5NCY0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Kdm6bQ5NCY0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
Kdm6bQ5NCY0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Kdm6bQ5NCY0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Kdm6bQ5NCY0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms