Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC41

1810065E05Rik, RIKEN cDNA 1810065E05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810065E05RikQ5NC41 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
1810065E05RikQ5NC41 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
1810065E05RikQ5NC41 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
1810065E05RikQ5NC41 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
1810065E05RikQ5NC41 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
1810065E05RikQ5NC41 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
1810065E05RikQ5NC41 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
1810065E05RikQ5NC41 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
1810065E05RikQ5NC41 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
1810065E05RikQ5NC41 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
1810065E05RikQ5NC41 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
1810065E05RikQ5NC41 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
1810065E05RikQ5NC41 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
1810065E05RikQ5NC41 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
1810065E05RikQ5NC41 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
1810065E05RikQ5NC41 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
1810065E05RikQ5NC41 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
1810065E05RikQ5NC41 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
1810065E05RikQ5NC41 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
1810065E05RikQ5NC41 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
1810065E05RikQ5NC41 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
1810065E05RikQ5NC41 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
1810065E05RikQ5NC41 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
1810065E05RikQ5NC41 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
1810065E05RikQ5NC41 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
1810065E05RikQ5NC41 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
1810065E05RikQ5NC41 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
1810065E05RikQ5NC41 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
1810065E05RikQ5NC41 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
1810065E05RikQ5NC41 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
1810065E05RikQ5NC41 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
1810065E05RikQ5NC41 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
1810065E05RikQ5NC41 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
1810065E05RikQ5NC41 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
1810065E05RikQ5NC41 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
1810065E05RikQ5NC41 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
1810065E05RikQ5NC41 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
1810065E05RikQ5NC41 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
1810065E05RikQ5NC41 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
1810065E05RikQ5NC41 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
1810065E05RikQ5NC41 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
1810065E05RikQ5NC41 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
1810065E05RikQ5NC41 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
1810065E05RikQ5NC41 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
1810065E05RikQ5NC41 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
1810065E05RikQ5NC41 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
1810065E05RikQ5NC41 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
1810065E05RikQ5NC41 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
1810065E05RikQ5NC41 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
1810065E05RikQ5NC41 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
1810065E05RikQ5NC41 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
1810065E05RikQ5NC41 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
1810065E05RikQ5NC41 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
1810065E05RikQ5NC41 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
1810065E05RikQ5NC41 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
1810065E05RikQ5NC41 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
1810065E05RikQ5NC41 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
1810065E05RikQ5NC41 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
1810065E05RikQ5NC41 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
1810065E05RikQ5NC41 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
1810065E05RikQ5NC41 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
1810065E05RikQ5NC41 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
1810065E05RikQ5NC41 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
1810065E05RikQ5NC41 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
1810065E05RikQ5NC41 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
1810065E05RikQ5NC41 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
1810065E05RikQ5NC41 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
1810065E05RikQ5NC41 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
1810065E05RikQ5NC41 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
1810065E05RikQ5NC41 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
1810065E05RikQ5NC41 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
1810065E05RikQ5NC41 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
1810065E05RikQ5NC41 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
1810065E05RikQ5NC41 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
1810065E05RikQ5NC41 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
1810065E05RikQ5NC41 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
1810065E05RikQ5NC41 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
1810065E05RikQ5NC41 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
1810065E05RikQ5NC41 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
1810065E05RikQ5NC41 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
1810065E05RikQ5NC41 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
1810065E05RikQ5NC41 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
1810065E05RikQ5NC41 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
1810065E05RikQ5NC41 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
1810065E05RikQ5NC41 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
1810065E05RikQ5NC41 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
1810065E05RikQ5NC41 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
1810065E05RikQ5NC41 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
1810065E05RikQ5NC41 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
1810065E05RikQ5NC41 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
1810065E05RikQ5NC41 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
1810065E05RikQ5NC41 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
1810065E05RikQ5NC41 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
1810065E05RikQ5NC41 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
1810065E05RikQ5NC41 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
1810065E05RikQ5NC41 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
1810065E05RikQ5NC41 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
1810065E05RikQ5NC41 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
1810065E05RikQ5NC41 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
1810065E05RikQ5NC41 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms