Protein–RNA interactions for Protein: Q5NBU5

Fbxo39, F-box only protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo39Q5NBU5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fbxo39Q5NBU5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fbxo39Q5NBU5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fbxo39Q5NBU5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Fbxo39Q5NBU5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fbxo39Q5NBU5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fbxo39Q5NBU5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fbxo39Q5NBU5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fbxo39Q5NBU5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Fbxo39Q5NBU5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fbxo39Q5NBU5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fbxo39Q5NBU5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Fbxo39Q5NBU5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fbxo39Q5NBU5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fbxo39Q5NBU5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fbxo39Q5NBU5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fbxo39Q5NBU5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fbxo39Q5NBU5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fbxo39Q5NBU5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fbxo39Q5NBU5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fbxo39Q5NBU5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Fbxo39Q5NBU5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fbxo39Q5NBU5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fbxo39Q5NBU5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fbxo39Q5NBU5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fbxo39Q5NBU5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Fbxo39Q5NBU5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Fbxo39Q5NBU5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fbxo39Q5NBU5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fbxo39Q5NBU5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fbxo39Q5NBU5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fbxo39Q5NBU5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fbxo39Q5NBU5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fbxo39Q5NBU5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fbxo39Q5NBU5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fbxo39Q5NBU5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fbxo39Q5NBU5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fbxo39Q5NBU5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fbxo39Q5NBU5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fbxo39Q5NBU5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Fbxo39Q5NBU5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Fbxo39Q5NBU5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Fbxo39Q5NBU5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fbxo39Q5NBU5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fbxo39Q5NBU5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Fbxo39Q5NBU5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fbxo39Q5NBU5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fbxo39Q5NBU5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fbxo39Q5NBU5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fbxo39Q5NBU5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fbxo39Q5NBU5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fbxo39Q5NBU5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fbxo39Q5NBU5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fbxo39Q5NBU5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fbxo39Q5NBU5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fbxo39Q5NBU5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fbxo39Q5NBU5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fbxo39Q5NBU5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fbxo39Q5NBU5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fbxo39Q5NBU5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fbxo39Q5NBU5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Fbxo39Q5NBU5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fbxo39Q5NBU5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fbxo39Q5NBU5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fbxo39Q5NBU5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fbxo39Q5NBU5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fbxo39Q5NBU5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fbxo39Q5NBU5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fbxo39Q5NBU5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fbxo39Q5NBU5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fbxo39Q5NBU5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fbxo39Q5NBU5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fbxo39Q5NBU5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fbxo39Q5NBU5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fbxo39Q5NBU5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fbxo39Q5NBU5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fbxo39Q5NBU5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fbxo39Q5NBU5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fbxo39Q5NBU5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fbxo39Q5NBU5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fbxo39Q5NBU5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fbxo39Q5NBU5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fbxo39Q5NBU5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fbxo39Q5NBU5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fbxo39Q5NBU5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fbxo39Q5NBU5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fbxo39Q5NBU5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fbxo39Q5NBU5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fbxo39Q5NBU5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fbxo39Q5NBU5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fbxo39Q5NBU5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fbxo39Q5NBU5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fbxo39Q5NBU5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fbxo39Q5NBU5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fbxo39Q5NBU5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fbxo39Q5NBU5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fbxo39Q5NBU5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fbxo39Q5NBU5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fbxo39Q5NBU5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fbxo39Q5NBU5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms