Protein–RNA interactions for Protein: Q5M6W3

Clhc1, Clathrin heavy chain linker domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clhc1Q5M6W3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clhc1Q5M6W3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clhc1Q5M6W3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clhc1Q5M6W3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clhc1Q5M6W3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clhc1Q5M6W3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clhc1Q5M6W3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clhc1Q5M6W3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clhc1Q5M6W3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clhc1Q5M6W3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clhc1Q5M6W3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clhc1Q5M6W3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clhc1Q5M6W3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clhc1Q5M6W3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clhc1Q5M6W3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clhc1Q5M6W3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Clhc1Q5M6W3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clhc1Q5M6W3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clhc1Q5M6W3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clhc1Q5M6W3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clhc1Q5M6W3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clhc1Q5M6W3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clhc1Q5M6W3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clhc1Q5M6W3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clhc1Q5M6W3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clhc1Q5M6W3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clhc1Q5M6W3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clhc1Q5M6W3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clhc1Q5M6W3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clhc1Q5M6W3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clhc1Q5M6W3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clhc1Q5M6W3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clhc1Q5M6W3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clhc1Q5M6W3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clhc1Q5M6W3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clhc1Q5M6W3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clhc1Q5M6W3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clhc1Q5M6W3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Clhc1Q5M6W3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clhc1Q5M6W3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clhc1Q5M6W3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clhc1Q5M6W3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clhc1Q5M6W3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clhc1Q5M6W3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clhc1Q5M6W3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clhc1Q5M6W3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clhc1Q5M6W3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clhc1Q5M6W3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clhc1Q5M6W3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clhc1Q5M6W3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clhc1Q5M6W3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clhc1Q5M6W3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clhc1Q5M6W3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clhc1Q5M6W3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clhc1Q5M6W3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clhc1Q5M6W3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clhc1Q5M6W3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clhc1Q5M6W3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clhc1Q5M6W3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clhc1Q5M6W3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clhc1Q5M6W3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clhc1Q5M6W3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clhc1Q5M6W3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clhc1Q5M6W3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clhc1Q5M6W3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Clhc1Q5M6W3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clhc1Q5M6W3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clhc1Q5M6W3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Clhc1Q5M6W3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clhc1Q5M6W3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clhc1Q5M6W3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clhc1Q5M6W3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clhc1Q5M6W3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clhc1Q5M6W3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Clhc1Q5M6W3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clhc1Q5M6W3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clhc1Q5M6W3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clhc1Q5M6W3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clhc1Q5M6W3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clhc1Q5M6W3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clhc1Q5M6W3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clhc1Q5M6W3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clhc1Q5M6W3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clhc1Q5M6W3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clhc1Q5M6W3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clhc1Q5M6W3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clhc1Q5M6W3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clhc1Q5M6W3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clhc1Q5M6W3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clhc1Q5M6W3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clhc1Q5M6W3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clhc1Q5M6W3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clhc1Q5M6W3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clhc1Q5M6W3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clhc1Q5M6W3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clhc1Q5M6W3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clhc1Q5M6W3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clhc1Q5M6W3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clhc1Q5M6W3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clhc1Q5M6W3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms