Protein–RNA interactions for Protein: Q5BLK4

Zcchc6, Terminal uridylyltransferase 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc6Q5BLK4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC44.42■■■■■ 4.7
Zcchc6Q5BLK4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC44.42■■■■■ 4.7
Zcchc6Q5BLK4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
Zcchc6Q5BLK4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
Zcchc6Q5BLK4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
Zcchc6Q5BLK4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC44.4■■■■■ 4.7
Zcchc6Q5BLK4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC44.4■■■■■ 4.7
Zcchc6Q5BLK4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
Zcchc6Q5BLK4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
Zcchc6Q5BLK4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
Zcchc6Q5BLK4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC44.38■■■■■ 4.7
Zcchc6Q5BLK4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.69
Zcchc6Q5BLK4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
Zcchc6Q5BLK4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC44.35■■■■■ 4.69
Zcchc6Q5BLK4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
Zcchc6Q5BLK4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.34■■■■■ 4.69
Zcchc6Q5BLK4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
Zcchc6Q5BLK4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
Zcchc6Q5BLK4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
Zcchc6Q5BLK4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC44.33■■■■■ 4.69
Zcchc6Q5BLK4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
Zcchc6Q5BLK4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC44.28■■■■■ 4.68
Zcchc6Q5BLK4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
Zcchc6Q5BLK4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
Zcchc6Q5BLK4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
Zcchc6Q5BLK4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
Zcchc6Q5BLK4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
Zcchc6Q5BLK4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
Zcchc6Q5BLK4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
Zcchc6Q5BLK4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
Zcchc6Q5BLK4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
Zcchc6Q5BLK4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
Zcchc6Q5BLK4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC44.21■■■■■ 4.67
Zcchc6Q5BLK4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC44.2■■■■■ 4.67
Zcchc6Q5BLK4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
Zcchc6Q5BLK4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.66
Zcchc6Q5BLK4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC44.17■■■■■ 4.66
Zcchc6Q5BLK4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
Zcchc6Q5BLK4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
Zcchc6Q5BLK4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.66
Zcchc6Q5BLK4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.11■■■■■ 4.65
Zcchc6Q5BLK4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC44.1■■■■■ 4.65
Zcchc6Q5BLK4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
Zcchc6Q5BLK4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
Zcchc6Q5BLK4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.08■■■■■ 4.65
Zcchc6Q5BLK4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC44.08■■■■■ 4.65
Zcchc6Q5BLK4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
Zcchc6Q5BLK4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
Zcchc6Q5BLK4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
Zcchc6Q5BLK4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
Zcchc6Q5BLK4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC44.02■■■■■ 4.64
Zcchc6Q5BLK4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
Zcchc6Q5BLK4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
Zcchc6Q5BLK4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
Zcchc6Q5BLK4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
Zcchc6Q5BLK4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
Zcchc6Q5BLK4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
Zcchc6Q5BLK4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
Zcchc6Q5BLK4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC44■■■■■ 4.63
Zcchc6Q5BLK4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
Zcchc6Q5BLK4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
Zcchc6Q5BLK4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
Zcchc6Q5BLK4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
Zcchc6Q5BLK4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC43.96■■■■■ 4.63
Zcchc6Q5BLK4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
Zcchc6Q5BLK4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
Zcchc6Q5BLK4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
Zcchc6Q5BLK4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
Zcchc6Q5BLK4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
Zcchc6Q5BLK4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
Zcchc6Q5BLK4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.92■■■■■ 4.62
Zcchc6Q5BLK4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC43.91■■■■■ 4.62
Zcchc6Q5BLK4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
Zcchc6Q5BLK4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
Zcchc6Q5BLK4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC43.9■■■■■ 4.62
Zcchc6Q5BLK4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC43.9■■■■■ 4.62
Zcchc6Q5BLK4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC43.9■■■■■ 4.62
Zcchc6Q5BLK4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
Zcchc6Q5BLK4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC43.9■■■■■ 4.62
Zcchc6Q5BLK4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC43.9■■■■■ 4.62
Zcchc6Q5BLK4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
Zcchc6Q5BLK4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC43.89■■■■■ 4.62
Zcchc6Q5BLK4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
Zcchc6Q5BLK4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.89■■■■■ 4.62
Zcchc6Q5BLK4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.62
Zcchc6Q5BLK4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.62
Zcchc6Q5BLK4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC43.88■■■■■ 4.61
Zcchc6Q5BLK4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.61
Zcchc6Q5BLK4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
Zcchc6Q5BLK4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC43.86■■■■■ 4.61
Zcchc6Q5BLK4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
Zcchc6Q5BLK4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC43.85■■■■■ 4.61
Zcchc6Q5BLK4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.84■■■■■ 4.61
Zcchc6Q5BLK4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC43.84■■■■■ 4.61
Zcchc6Q5BLK4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC43.83■■■■■ 4.61
Zcchc6Q5BLK4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
Zcchc6Q5BLK4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
Zcchc6Q5BLK4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
Zcchc6Q5BLK4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
Zcchc6Q5BLK4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms