Protein–RNA interactions for Protein: Q571H0

Urb1, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb1Q571H0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Urb1Q571H0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Urb1Q571H0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Urb1Q571H0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Urb1Q571H0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Urb1Q571H0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Urb1Q571H0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Urb1Q571H0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Urb1Q571H0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Urb1Q571H0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Urb1Q571H0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Urb1Q571H0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Urb1Q571H0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Urb1Q571H0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Urb1Q571H0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Urb1Q571H0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Urb1Q571H0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Urb1Q571H0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Urb1Q571H0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Urb1Q571H0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Urb1Q571H0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Urb1Q571H0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Urb1Q571H0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Urb1Q571H0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Urb1Q571H0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Urb1Q571H0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Urb1Q571H0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Urb1Q571H0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Urb1Q571H0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Urb1Q571H0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Urb1Q571H0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Urb1Q571H0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Urb1Q571H0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Urb1Q571H0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Urb1Q571H0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Urb1Q571H0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Urb1Q571H0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Urb1Q571H0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Urb1Q571H0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Urb1Q571H0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Urb1Q571H0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Urb1Q571H0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Urb1Q571H0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Urb1Q571H0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Urb1Q571H0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Urb1Q571H0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Urb1Q571H0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Urb1Q571H0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Urb1Q571H0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Urb1Q571H0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Urb1Q571H0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Urb1Q571H0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Urb1Q571H0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Urb1Q571H0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Urb1Q571H0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Urb1Q571H0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Urb1Q571H0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Urb1Q571H0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Urb1Q571H0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Urb1Q571H0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Urb1Q571H0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Urb1Q571H0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Urb1Q571H0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Urb1Q571H0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Urb1Q571H0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Urb1Q571H0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Urb1Q571H0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Urb1Q571H0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Urb1Q571H0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Urb1Q571H0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Urb1Q571H0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Urb1Q571H0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Urb1Q571H0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Urb1Q571H0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Urb1Q571H0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Urb1Q571H0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Urb1Q571H0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Urb1Q571H0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Urb1Q571H0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Urb1Q571H0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Urb1Q571H0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Urb1Q571H0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Urb1Q571H0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Urb1Q571H0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Urb1Q571H0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Urb1Q571H0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Urb1Q571H0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Urb1Q571H0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Urb1Q571H0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Urb1Q571H0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Urb1Q571H0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Urb1Q571H0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Urb1Q571H0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Urb1Q571H0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Urb1Q571H0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Urb1Q571H0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Urb1Q571H0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Urb1Q571H0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Urb1Q571H0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Urb1Q571H0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms