Protein–RNA interactions for Protein: Q571H0

Urb1, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb1Q571H0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Urb1Q571H0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Urb1Q571H0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Urb1Q571H0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Urb1Q571H0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Urb1Q571H0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Urb1Q571H0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Urb1Q571H0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Urb1Q571H0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Urb1Q571H0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Urb1Q571H0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Urb1Q571H0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Urb1Q571H0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Urb1Q571H0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Urb1Q571H0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Urb1Q571H0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Urb1Q571H0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Urb1Q571H0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Urb1Q571H0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Urb1Q571H0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Urb1Q571H0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Urb1Q571H0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Urb1Q571H0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Urb1Q571H0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Urb1Q571H0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Urb1Q571H0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Urb1Q571H0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Urb1Q571H0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Urb1Q571H0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Urb1Q571H0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Urb1Q571H0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Urb1Q571H0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Urb1Q571H0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Urb1Q571H0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Urb1Q571H0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Urb1Q571H0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Urb1Q571H0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Urb1Q571H0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Urb1Q571H0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Urb1Q571H0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Urb1Q571H0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Urb1Q571H0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Urb1Q571H0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Urb1Q571H0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Urb1Q571H0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Urb1Q571H0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Urb1Q571H0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Urb1Q571H0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Urb1Q571H0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Urb1Q571H0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Urb1Q571H0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Urb1Q571H0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Urb1Q571H0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Urb1Q571H0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Urb1Q571H0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Urb1Q571H0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Urb1Q571H0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Urb1Q571H0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Urb1Q571H0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Urb1Q571H0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Urb1Q571H0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Urb1Q571H0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Urb1Q571H0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Urb1Q571H0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Urb1Q571H0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Urb1Q571H0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Urb1Q571H0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Urb1Q571H0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Urb1Q571H0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Urb1Q571H0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Urb1Q571H0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Urb1Q571H0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Urb1Q571H0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Urb1Q571H0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Urb1Q571H0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Urb1Q571H0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Urb1Q571H0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Urb1Q571H0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Urb1Q571H0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Urb1Q571H0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Urb1Q571H0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Urb1Q571H0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Urb1Q571H0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Urb1Q571H0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Urb1Q571H0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Urb1Q571H0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Urb1Q571H0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Urb1Q571H0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Urb1Q571H0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Urb1Q571H0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Urb1Q571H0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Urb1Q571H0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Urb1Q571H0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Urb1Q571H0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Urb1Q571H0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Urb1Q571H0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Urb1Q571H0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Urb1Q571H0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Urb1Q571H0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Urb1Q571H0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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