Protein–RNA interactions for Protein: Q52KP5

Nxpe4, NXPE family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxpe4Q52KP5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nxpe4Q52KP5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nxpe4Q52KP5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nxpe4Q52KP5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nxpe4Q52KP5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nxpe4Q52KP5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nxpe4Q52KP5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nxpe4Q52KP5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nxpe4Q52KP5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nxpe4Q52KP5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nxpe4Q52KP5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nxpe4Q52KP5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nxpe4Q52KP5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nxpe4Q52KP5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nxpe4Q52KP5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Nxpe4Q52KP5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nxpe4Q52KP5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nxpe4Q52KP5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nxpe4Q52KP5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nxpe4Q52KP5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nxpe4Q52KP5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nxpe4Q52KP5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Nxpe4Q52KP5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nxpe4Q52KP5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nxpe4Q52KP5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nxpe4Q52KP5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Nxpe4Q52KP5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Nxpe4Q52KP5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nxpe4Q52KP5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nxpe4Q52KP5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nxpe4Q52KP5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nxpe4Q52KP5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nxpe4Q52KP5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nxpe4Q52KP5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nxpe4Q52KP5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nxpe4Q52KP5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nxpe4Q52KP5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nxpe4Q52KP5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nxpe4Q52KP5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nxpe4Q52KP5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nxpe4Q52KP5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nxpe4Q52KP5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nxpe4Q52KP5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nxpe4Q52KP5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nxpe4Q52KP5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nxpe4Q52KP5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nxpe4Q52KP5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nxpe4Q52KP5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nxpe4Q52KP5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nxpe4Q52KP5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nxpe4Q52KP5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Nxpe4Q52KP5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nxpe4Q52KP5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nxpe4Q52KP5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nxpe4Q52KP5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nxpe4Q52KP5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nxpe4Q52KP5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nxpe4Q52KP5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nxpe4Q52KP5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Nxpe4Q52KP5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nxpe4Q52KP5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nxpe4Q52KP5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nxpe4Q52KP5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nxpe4Q52KP5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nxpe4Q52KP5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nxpe4Q52KP5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nxpe4Q52KP5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nxpe4Q52KP5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nxpe4Q52KP5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nxpe4Q52KP5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nxpe4Q52KP5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nxpe4Q52KP5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nxpe4Q52KP5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Nxpe4Q52KP5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nxpe4Q52KP5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nxpe4Q52KP5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nxpe4Q52KP5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Nxpe4Q52KP5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nxpe4Q52KP5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nxpe4Q52KP5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nxpe4Q52KP5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nxpe4Q52KP5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nxpe4Q52KP5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nxpe4Q52KP5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nxpe4Q52KP5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nxpe4Q52KP5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nxpe4Q52KP5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nxpe4Q52KP5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nxpe4Q52KP5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nxpe4Q52KP5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nxpe4Q52KP5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nxpe4Q52KP5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nxpe4Q52KP5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nxpe4Q52KP5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nxpe4Q52KP5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nxpe4Q52KP5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nxpe4Q52KP5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nxpe4Q52KP5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nxpe4Q52KP5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nxpe4Q52KP5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms