Protein–RNA interactions for Protein: Q497V5

Srbd1, S1 RNA-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srbd1Q497V5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Srbd1Q497V5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Srbd1Q497V5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Srbd1Q497V5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Srbd1Q497V5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Srbd1Q497V5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Srbd1Q497V5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Srbd1Q497V5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Srbd1Q497V5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Srbd1Q497V5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Srbd1Q497V5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Srbd1Q497V5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Srbd1Q497V5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Srbd1Q497V5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Srbd1Q497V5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Srbd1Q497V5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Srbd1Q497V5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Srbd1Q497V5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Srbd1Q497V5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Srbd1Q497V5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Srbd1Q497V5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Srbd1Q497V5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Srbd1Q497V5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Srbd1Q497V5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Srbd1Q497V5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Srbd1Q497V5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Srbd1Q497V5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Srbd1Q497V5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Srbd1Q497V5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Srbd1Q497V5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Srbd1Q497V5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Srbd1Q497V5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Srbd1Q497V5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Srbd1Q497V5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Srbd1Q497V5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Srbd1Q497V5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Srbd1Q497V5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Srbd1Q497V5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Srbd1Q497V5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Srbd1Q497V5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Srbd1Q497V5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Srbd1Q497V5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Srbd1Q497V5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Srbd1Q497V5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Srbd1Q497V5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Srbd1Q497V5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Srbd1Q497V5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Srbd1Q497V5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Srbd1Q497V5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Srbd1Q497V5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Srbd1Q497V5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Srbd1Q497V5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Srbd1Q497V5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Srbd1Q497V5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Srbd1Q497V5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Srbd1Q497V5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Srbd1Q497V5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Srbd1Q497V5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Srbd1Q497V5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Srbd1Q497V5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Srbd1Q497V5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Srbd1Q497V5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Srbd1Q497V5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Srbd1Q497V5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Srbd1Q497V5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Srbd1Q497V5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Srbd1Q497V5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Srbd1Q497V5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Srbd1Q497V5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Srbd1Q497V5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Srbd1Q497V5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Srbd1Q497V5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Srbd1Q497V5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Srbd1Q497V5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Srbd1Q497V5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Srbd1Q497V5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Srbd1Q497V5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Srbd1Q497V5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Srbd1Q497V5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Srbd1Q497V5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Srbd1Q497V5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Srbd1Q497V5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Srbd1Q497V5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Srbd1Q497V5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Srbd1Q497V5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Srbd1Q497V5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Srbd1Q497V5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Srbd1Q497V5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Srbd1Q497V5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Srbd1Q497V5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Srbd1Q497V5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Srbd1Q497V5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Srbd1Q497V5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Srbd1Q497V5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Srbd1Q497V5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Srbd1Q497V5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Srbd1Q497V5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Srbd1Q497V5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Srbd1Q497V5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Srbd1Q497V5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms