Protein–RNA interactions for Protein: Q497S0

Gm5935, EG546282 protein, mousemouse

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5935Q497S0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm5935Q497S0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm5935Q497S0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm5935Q497S0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm5935Q497S0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm5935Q497S0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm5935Q497S0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm5935Q497S0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm5935Q497S0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm5935Q497S0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm5935Q497S0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm5935Q497S0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm5935Q497S0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm5935Q497S0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm5935Q497S0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm5935Q497S0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm5935Q497S0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm5935Q497S0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm5935Q497S0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm5935Q497S0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm5935Q497S0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm5935Q497S0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm5935Q497S0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm5935Q497S0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm5935Q497S0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm5935Q497S0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm5935Q497S0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm5935Q497S0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm5935Q497S0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm5935Q497S0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gm5935Q497S0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm5935Q497S0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm5935Q497S0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm5935Q497S0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm5935Q497S0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm5935Q497S0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm5935Q497S0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm5935Q497S0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm5935Q497S0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm5935Q497S0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm5935Q497S0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm5935Q497S0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm5935Q497S0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm5935Q497S0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm5935Q497S0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm5935Q497S0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm5935Q497S0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm5935Q497S0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm5935Q497S0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm5935Q497S0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm5935Q497S0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm5935Q497S0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm5935Q497S0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm5935Q497S0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm5935Q497S0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm5935Q497S0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm5935Q497S0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm5935Q497S0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm5935Q497S0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm5935Q497S0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm5935Q497S0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm5935Q497S0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm5935Q497S0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm5935Q497S0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm5935Q497S0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm5935Q497S0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm5935Q497S0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm5935Q497S0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm5935Q497S0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm5935Q497S0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm5935Q497S0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm5935Q497S0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm5935Q497S0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm5935Q497S0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm5935Q497S0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm5935Q497S0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm5935Q497S0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm5935Q497S0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm5935Q497S0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm5935Q497S0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm5935Q497S0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm5935Q497S0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm5935Q497S0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm5935Q497S0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm5935Q497S0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm5935Q497S0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm5935Q497S0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm5935Q497S0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm5935Q497S0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm5935Q497S0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm5935Q497S0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm5935Q497S0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm5935Q497S0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm5935Q497S0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm5935Q497S0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm5935Q497S0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm5935Q497S0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm5935Q497S0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm5935Q497S0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm5935Q497S0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
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