Protein–RNA interactions for Protein: Q497Q6

Fam228b, Protein FAM228B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228bQ497Q6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Fam228bQ497Q6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Fam228bQ497Q6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Fam228bQ497Q6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Fam228bQ497Q6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Fam228bQ497Q6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Fam228bQ497Q6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Fam228bQ497Q6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Fam228bQ497Q6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Fam228bQ497Q6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Fam228bQ497Q6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Fam228bQ497Q6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Fam228bQ497Q6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Fam228bQ497Q6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Fam228bQ497Q6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Fam228bQ497Q6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Fam228bQ497Q6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Fam228bQ497Q6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Fam228bQ497Q6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Fam228bQ497Q6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Fam228bQ497Q6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Fam228bQ497Q6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Fam228bQ497Q6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Fam228bQ497Q6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Fam228bQ497Q6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Fam228bQ497Q6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Fam228bQ497Q6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Fam228bQ497Q6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Fam228bQ497Q6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Fam228bQ497Q6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Fam228bQ497Q6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Fam228bQ497Q6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Fam228bQ497Q6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Fam228bQ497Q6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Fam228bQ497Q6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Fam228bQ497Q6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Fam228bQ497Q6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Fam228bQ497Q6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Fam228bQ497Q6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Fam228bQ497Q6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Fam228bQ497Q6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Fam228bQ497Q6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Fam228bQ497Q6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Fam228bQ497Q6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Fam228bQ497Q6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Fam228bQ497Q6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Fam228bQ497Q6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Fam228bQ497Q6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Fam228bQ497Q6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Fam228bQ497Q6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Fam228bQ497Q6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Fam228bQ497Q6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Fam228bQ497Q6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Fam228bQ497Q6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Fam228bQ497Q6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Fam228bQ497Q6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Fam228bQ497Q6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Fam228bQ497Q6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Fam228bQ497Q6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Fam228bQ497Q6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Fam228bQ497Q6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Fam228bQ497Q6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Fam228bQ497Q6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Fam228bQ497Q6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Fam228bQ497Q6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Fam228bQ497Q6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Fam228bQ497Q6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Fam228bQ497Q6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Fam228bQ497Q6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Fam228bQ497Q6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Fam228bQ497Q6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Fam228bQ497Q6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Fam228bQ497Q6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Fam228bQ497Q6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Fam228bQ497Q6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Fam228bQ497Q6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Fam228bQ497Q6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Fam228bQ497Q6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Fam228bQ497Q6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Fam228bQ497Q6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Fam228bQ497Q6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Fam228bQ497Q6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fam228bQ497Q6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fam228bQ497Q6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Fam228bQ497Q6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Fam228bQ497Q6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Fam228bQ497Q6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Fam228bQ497Q6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Fam228bQ497Q6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Fam228bQ497Q6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Fam228bQ497Q6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Fam228bQ497Q6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Fam228bQ497Q6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fam228bQ497Q6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fam228bQ497Q6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fam228bQ497Q6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fam228bQ497Q6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Fam228bQ497Q6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Fam228bQ497Q6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Fam228bQ497Q6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms