Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ulk4Q3V129 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ulk4Q3V129 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ulk4Q3V129 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ulk4Q3V129 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ulk4Q3V129 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ulk4Q3V129 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ulk4Q3V129 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ulk4Q3V129 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ulk4Q3V129 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ulk4Q3V129 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ulk4Q3V129 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ulk4Q3V129 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ulk4Q3V129 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ulk4Q3V129 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ulk4Q3V129 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Ulk4Q3V129 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Ulk4Q3V129 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ulk4Q3V129 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ulk4Q3V129 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ulk4Q3V129 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ulk4Q3V129 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ulk4Q3V129 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Ulk4Q3V129 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ulk4Q3V129 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ulk4Q3V129 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ulk4Q3V129 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ulk4Q3V129 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ulk4Q3V129 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ulk4Q3V129 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ulk4Q3V129 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ulk4Q3V129 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ulk4Q3V129 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ulk4Q3V129 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ulk4Q3V129 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Ulk4Q3V129 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ulk4Q3V129 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ulk4Q3V129 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ulk4Q3V129 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ulk4Q3V129 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ulk4Q3V129 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ulk4Q3V129 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ulk4Q3V129 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ulk4Q3V129 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ulk4Q3V129 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ulk4Q3V129 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ulk4Q3V129 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ulk4Q3V129 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ulk4Q3V129 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ulk4Q3V129 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ulk4Q3V129 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ulk4Q3V129 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ulk4Q3V129 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ulk4Q3V129 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ulk4Q3V129 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Ulk4Q3V129 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ulk4Q3V129 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ulk4Q3V129 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ulk4Q3V129 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Ulk4Q3V129 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ulk4Q3V129 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ulk4Q3V129 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
Ulk4Q3V129 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Ulk4Q3V129 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ulk4Q3V129 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ulk4Q3V129 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ulk4Q3V129 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ulk4Q3V129 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Ulk4Q3V129 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Ulk4Q3V129 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Ulk4Q3V129 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ulk4Q3V129 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ulk4Q3V129 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ulk4Q3V129 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ulk4Q3V129 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ulk4Q3V129 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ulk4Q3V129 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ulk4Q3V129 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ulk4Q3V129 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ulk4Q3V129 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ulk4Q3V129 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ulk4Q3V129 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ulk4Q3V129 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ulk4Q3V129 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ulk4Q3V129 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ulk4Q3V129 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ulk4Q3V129 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ulk4Q3V129 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ulk4Q3V129 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ulk4Q3V129 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ulk4Q3V129 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ulk4Q3V129 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ulk4Q3V129 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ulk4Q3V129 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ulk4Q3V129 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ulk4Q3V129 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ulk4Q3V129 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ulk4Q3V129 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ulk4Q3V129 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ulk4Q3V129 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.9 ms