Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M1

Gm906, Gene model 906, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm906Q3V0M1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm906Q3V0M1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm906Q3V0M1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm906Q3V0M1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm906Q3V0M1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm906Q3V0M1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm906Q3V0M1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm906Q3V0M1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm906Q3V0M1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm906Q3V0M1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm906Q3V0M1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm906Q3V0M1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm906Q3V0M1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm906Q3V0M1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm906Q3V0M1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm906Q3V0M1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm906Q3V0M1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm906Q3V0M1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm906Q3V0M1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm906Q3V0M1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm906Q3V0M1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm906Q3V0M1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm906Q3V0M1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm906Q3V0M1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm906Q3V0M1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm906Q3V0M1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm906Q3V0M1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm906Q3V0M1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm906Q3V0M1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm906Q3V0M1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm906Q3V0M1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm906Q3V0M1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm906Q3V0M1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm906Q3V0M1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm906Q3V0M1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm906Q3V0M1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm906Q3V0M1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm906Q3V0M1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm906Q3V0M1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm906Q3V0M1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm906Q3V0M1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm906Q3V0M1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm906Q3V0M1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm906Q3V0M1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm906Q3V0M1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm906Q3V0M1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm906Q3V0M1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm906Q3V0M1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm906Q3V0M1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm906Q3V0M1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm906Q3V0M1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm906Q3V0M1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm906Q3V0M1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm906Q3V0M1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm906Q3V0M1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm906Q3V0M1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm906Q3V0M1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm906Q3V0M1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm906Q3V0M1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm906Q3V0M1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm906Q3V0M1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm906Q3V0M1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm906Q3V0M1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm906Q3V0M1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm906Q3V0M1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm906Q3V0M1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm906Q3V0M1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm906Q3V0M1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm906Q3V0M1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm906Q3V0M1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm906Q3V0M1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm906Q3V0M1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm906Q3V0M1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm906Q3V0M1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm906Q3V0M1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm906Q3V0M1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm906Q3V0M1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm906Q3V0M1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm906Q3V0M1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm906Q3V0M1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm906Q3V0M1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm906Q3V0M1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm906Q3V0M1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm906Q3V0M1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm906Q3V0M1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm906Q3V0M1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm906Q3V0M1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm906Q3V0M1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm906Q3V0M1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm906Q3V0M1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm906Q3V0M1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm906Q3V0M1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm906Q3V0M1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm906Q3V0M1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm906Q3V0M1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm906Q3V0M1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm906Q3V0M1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm906Q3V0M1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm906Q3V0M1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm906Q3V0M1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.8 ms