Protein–RNA interactions for Protein: Q3V089

Rbm44, RNA-binding protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm44Q3V089 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rbm44Q3V089 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rbm44Q3V089 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rbm44Q3V089 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rbm44Q3V089 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rbm44Q3V089 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rbm44Q3V089 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rbm44Q3V089 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rbm44Q3V089 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rbm44Q3V089 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rbm44Q3V089 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rbm44Q3V089 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rbm44Q3V089 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rbm44Q3V089 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rbm44Q3V089 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rbm44Q3V089 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rbm44Q3V089 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rbm44Q3V089 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rbm44Q3V089 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rbm44Q3V089 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rbm44Q3V089 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rbm44Q3V089 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rbm44Q3V089 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rbm44Q3V089 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rbm44Q3V089 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rbm44Q3V089 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rbm44Q3V089 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rbm44Q3V089 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rbm44Q3V089 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rbm44Q3V089 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rbm44Q3V089 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rbm44Q3V089 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rbm44Q3V089 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rbm44Q3V089 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rbm44Q3V089 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rbm44Q3V089 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rbm44Q3V089 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rbm44Q3V089 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rbm44Q3V089 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbm44Q3V089 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbm44Q3V089 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbm44Q3V089 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbm44Q3V089 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbm44Q3V089 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbm44Q3V089 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbm44Q3V089 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbm44Q3V089 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rbm44Q3V089 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rbm44Q3V089 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rbm44Q3V089 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbm44Q3V089 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbm44Q3V089 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbm44Q3V089 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbm44Q3V089 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbm44Q3V089 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbm44Q3V089 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbm44Q3V089 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbm44Q3V089 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbm44Q3V089 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rbm44Q3V089 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rbm44Q3V089 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rbm44Q3V089 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rbm44Q3V089 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rbm44Q3V089 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rbm44Q3V089 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rbm44Q3V089 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rbm44Q3V089 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rbm44Q3V089 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rbm44Q3V089 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rbm44Q3V089 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rbm44Q3V089 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rbm44Q3V089 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rbm44Q3V089 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rbm44Q3V089 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rbm44Q3V089 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rbm44Q3V089 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rbm44Q3V089 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rbm44Q3V089 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rbm44Q3V089 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rbm44Q3V089 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rbm44Q3V089 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rbm44Q3V089 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rbm44Q3V089 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rbm44Q3V089 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbm44Q3V089 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbm44Q3V089 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbm44Q3V089 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbm44Q3V089 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbm44Q3V089 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbm44Q3V089 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbm44Q3V089 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbm44Q3V089 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbm44Q3V089 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbm44Q3V089 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbm44Q3V089 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbm44Q3V089 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbm44Q3V089 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbm44Q3V089 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbm44Q3V089 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm44Q3V089 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms