Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Lrrfip1Q3UZ39 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lrrfip1Q3UZ39 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lrrfip1Q3UZ39 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lrrfip1Q3UZ39 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Lrrfip1Q3UZ39 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lrrfip1Q3UZ39 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lrrfip1Q3UZ39 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lrrfip1Q3UZ39 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lrrfip1Q3UZ39 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lrrfip1Q3UZ39 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lrrfip1Q3UZ39 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lrrfip1Q3UZ39 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lrrfip1Q3UZ39 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lrrfip1Q3UZ39 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Lrrfip1Q3UZ39 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lrrfip1Q3UZ39 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lrrfip1Q3UZ39 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lrrfip1Q3UZ39 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lrrfip1Q3UZ39 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lrrfip1Q3UZ39 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lrrfip1Q3UZ39 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lrrfip1Q3UZ39 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Lrrfip1Q3UZ39 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lrrfip1Q3UZ39 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lrrfip1Q3UZ39 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lrrfip1Q3UZ39 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lrrfip1Q3UZ39 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lrrfip1Q3UZ39 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lrrfip1Q3UZ39 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lrrfip1Q3UZ39 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lrrfip1Q3UZ39 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lrrfip1Q3UZ39 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lrrfip1Q3UZ39 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lrrfip1Q3UZ39 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lrrfip1Q3UZ39 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lrrfip1Q3UZ39 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lrrfip1Q3UZ39 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lrrfip1Q3UZ39 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lrrfip1Q3UZ39 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lrrfip1Q3UZ39 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Lrrfip1Q3UZ39 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lrrfip1Q3UZ39 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Lrrfip1Q3UZ39 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lrrfip1Q3UZ39 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Lrrfip1Q3UZ39 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Lrrfip1Q3UZ39 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Lrrfip1Q3UZ39 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Lrrfip1Q3UZ39 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Lrrfip1Q3UZ39 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lrrfip1Q3UZ39 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lrrfip1Q3UZ39 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lrrfip1Q3UZ39 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Lrrfip1Q3UZ39 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Lrrfip1Q3UZ39 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Lrrfip1Q3UZ39 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Lrrfip1Q3UZ39 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Lrrfip1Q3UZ39 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Lrrfip1Q3UZ39 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Lrrfip1Q3UZ39 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Lrrfip1Q3UZ39 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Lrrfip1Q3UZ39 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Lrrfip1Q3UZ39 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Lrrfip1Q3UZ39 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Lrrfip1Q3UZ39 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Lrrfip1Q3UZ39 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lrrfip1Q3UZ39 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Lrrfip1Q3UZ39 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Lrrfip1Q3UZ39 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lrrfip1Q3UZ39 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lrrfip1Q3UZ39 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lrrfip1Q3UZ39 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lrrfip1Q3UZ39 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Lrrfip1Q3UZ39 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Lrrfip1Q3UZ39 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Lrrfip1Q3UZ39 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lrrfip1Q3UZ39 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lrrfip1Q3UZ39 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lrrfip1Q3UZ39 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lrrfip1Q3UZ39 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lrrfip1Q3UZ39 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lrrfip1Q3UZ39 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lrrfip1Q3UZ39 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lrrfip1Q3UZ39 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lrrfip1Q3UZ39 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lrrfip1Q3UZ39 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lrrfip1Q3UZ39 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lrrfip1Q3UZ39 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lrrfip1Q3UZ39 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lrrfip1Q3UZ39 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lrrfip1Q3UZ39 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lrrfip1Q3UZ39 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lrrfip1Q3UZ39 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lrrfip1Q3UZ39 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lrrfip1Q3UZ39 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lrrfip1Q3UZ39 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Lrrfip1Q3UZ39 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lrrfip1Q3UZ39 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lrrfip1Q3UZ39 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms