Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYV8

Dnaaf3, Dynein assembly factor 3, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf3Q3UYV8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnaaf3Q3UYV8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnaaf3Q3UYV8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnaaf3Q3UYV8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnaaf3Q3UYV8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dnaaf3Q3UYV8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnaaf3Q3UYV8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dnaaf3Q3UYV8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Dnaaf3Q3UYV8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dnaaf3Q3UYV8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dnaaf3Q3UYV8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dnaaf3Q3UYV8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dnaaf3Q3UYV8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dnaaf3Q3UYV8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dnaaf3Q3UYV8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dnaaf3Q3UYV8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dnaaf3Q3UYV8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dnaaf3Q3UYV8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dnaaf3Q3UYV8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dnaaf3Q3UYV8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dnaaf3Q3UYV8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Dnaaf3Q3UYV8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dnaaf3Q3UYV8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dnaaf3Q3UYV8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dnaaf3Q3UYV8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dnaaf3Q3UYV8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dnaaf3Q3UYV8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dnaaf3Q3UYV8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dnaaf3Q3UYV8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dnaaf3Q3UYV8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dnaaf3Q3UYV8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dnaaf3Q3UYV8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dnaaf3Q3UYV8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dnaaf3Q3UYV8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dnaaf3Q3UYV8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dnaaf3Q3UYV8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dnaaf3Q3UYV8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dnaaf3Q3UYV8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dnaaf3Q3UYV8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dnaaf3Q3UYV8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dnaaf3Q3UYV8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dnaaf3Q3UYV8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnaaf3Q3UYV8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnaaf3Q3UYV8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnaaf3Q3UYV8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnaaf3Q3UYV8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnaaf3Q3UYV8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnaaf3Q3UYV8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnaaf3Q3UYV8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnaaf3Q3UYV8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnaaf3Q3UYV8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnaaf3Q3UYV8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnaaf3Q3UYV8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnaaf3Q3UYV8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnaaf3Q3UYV8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnaaf3Q3UYV8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnaaf3Q3UYV8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnaaf3Q3UYV8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnaaf3Q3UYV8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnaaf3Q3UYV8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnaaf3Q3UYV8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dnaaf3Q3UYV8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dnaaf3Q3UYV8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnaaf3Q3UYV8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnaaf3Q3UYV8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnaaf3Q3UYV8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnaaf3Q3UYV8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnaaf3Q3UYV8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnaaf3Q3UYV8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Dnaaf3Q3UYV8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnaaf3Q3UYV8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnaaf3Q3UYV8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnaaf3Q3UYV8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnaaf3Q3UYV8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnaaf3Q3UYV8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnaaf3Q3UYV8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnaaf3Q3UYV8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnaaf3Q3UYV8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnaaf3Q3UYV8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnaaf3Q3UYV8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnaaf3Q3UYV8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnaaf3Q3UYV8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnaaf3Q3UYV8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnaaf3Q3UYV8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dnaaf3Q3UYV8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dnaaf3Q3UYV8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dnaaf3Q3UYV8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dnaaf3Q3UYV8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dnaaf3Q3UYV8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dnaaf3Q3UYV8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnaaf3Q3UYV8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnaaf3Q3UYV8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnaaf3Q3UYV8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnaaf3Q3UYV8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnaaf3Q3UYV8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnaaf3Q3UYV8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnaaf3Q3UYV8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnaaf3Q3UYV8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnaaf3Q3UYV8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms