Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX66

7420426K07Rik, RIKEN cDNA 7420426K07 gene, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
7420426K07RikQ3UX66 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
7420426K07RikQ3UX66 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
7420426K07RikQ3UX66 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
7420426K07RikQ3UX66 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
7420426K07RikQ3UX66 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
7420426K07RikQ3UX66 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
7420426K07RikQ3UX66 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
7420426K07RikQ3UX66 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
7420426K07RikQ3UX66 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
7420426K07RikQ3UX66 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
7420426K07RikQ3UX66 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
7420426K07RikQ3UX66 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
7420426K07RikQ3UX66 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
7420426K07RikQ3UX66 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
7420426K07RikQ3UX66 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
7420426K07RikQ3UX66 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
7420426K07RikQ3UX66 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
7420426K07RikQ3UX66 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
7420426K07RikQ3UX66 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
7420426K07RikQ3UX66 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
7420426K07RikQ3UX66 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
7420426K07RikQ3UX66 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
7420426K07RikQ3UX66 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
7420426K07RikQ3UX66 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
7420426K07RikQ3UX66 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
7420426K07RikQ3UX66 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
7420426K07RikQ3UX66 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
7420426K07RikQ3UX66 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
7420426K07RikQ3UX66 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
7420426K07RikQ3UX66 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
7420426K07RikQ3UX66 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
7420426K07RikQ3UX66 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
7420426K07RikQ3UX66 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
7420426K07RikQ3UX66 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
7420426K07RikQ3UX66 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
7420426K07RikQ3UX66 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
7420426K07RikQ3UX66 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
7420426K07RikQ3UX66 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
7420426K07RikQ3UX66 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
7420426K07RikQ3UX66 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
7420426K07RikQ3UX66 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
7420426K07RikQ3UX66 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
7420426K07RikQ3UX66 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
7420426K07RikQ3UX66 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
7420426K07RikQ3UX66 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
7420426K07RikQ3UX66 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
7420426K07RikQ3UX66 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
7420426K07RikQ3UX66 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
7420426K07RikQ3UX66 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
7420426K07RikQ3UX66 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
7420426K07RikQ3UX66 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
7420426K07RikQ3UX66 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
7420426K07RikQ3UX66 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
7420426K07RikQ3UX66 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
7420426K07RikQ3UX66 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
7420426K07RikQ3UX66 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
7420426K07RikQ3UX66 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
7420426K07RikQ3UX66 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
7420426K07RikQ3UX66 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
7420426K07RikQ3UX66 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
7420426K07RikQ3UX66 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
7420426K07RikQ3UX66 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
7420426K07RikQ3UX66 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
7420426K07RikQ3UX66 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
7420426K07RikQ3UX66 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
7420426K07RikQ3UX66 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
7420426K07RikQ3UX66 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
7420426K07RikQ3UX66 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
7420426K07RikQ3UX66 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
7420426K07RikQ3UX66 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
7420426K07RikQ3UX66 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
7420426K07RikQ3UX66 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
7420426K07RikQ3UX66 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
7420426K07RikQ3UX66 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
7420426K07RikQ3UX66 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
7420426K07RikQ3UX66 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
7420426K07RikQ3UX66 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
7420426K07RikQ3UX66 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
7420426K07RikQ3UX66 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
7420426K07RikQ3UX66 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
7420426K07RikQ3UX66 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
7420426K07RikQ3UX66 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
7420426K07RikQ3UX66 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
7420426K07RikQ3UX66 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
7420426K07RikQ3UX66 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
7420426K07RikQ3UX66 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
7420426K07RikQ3UX66 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
7420426K07RikQ3UX66 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
7420426K07RikQ3UX66 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
7420426K07RikQ3UX66 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
7420426K07RikQ3UX66 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
7420426K07RikQ3UX66 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
7420426K07RikQ3UX66 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
7420426K07RikQ3UX66 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
7420426K07RikQ3UX66 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
7420426K07RikQ3UX66 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
7420426K07RikQ3UX66 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
7420426K07RikQ3UX66 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
7420426K07RikQ3UX66 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
7420426K07RikQ3UX66 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms