Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWE6

Wdr20, MCG14935, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr20Q3UWE6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Wdr20Q3UWE6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Wdr20Q3UWE6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Wdr20Q3UWE6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Wdr20Q3UWE6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Wdr20Q3UWE6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Wdr20Q3UWE6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Wdr20Q3UWE6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Wdr20Q3UWE6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Wdr20Q3UWE6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Wdr20Q3UWE6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Wdr20Q3UWE6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Wdr20Q3UWE6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Wdr20Q3UWE6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Wdr20Q3UWE6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Wdr20Q3UWE6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Wdr20Q3UWE6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Wdr20Q3UWE6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Wdr20Q3UWE6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Wdr20Q3UWE6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Wdr20Q3UWE6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Wdr20Q3UWE6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Wdr20Q3UWE6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Wdr20Q3UWE6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Wdr20Q3UWE6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Wdr20Q3UWE6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Wdr20Q3UWE6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Wdr20Q3UWE6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Wdr20Q3UWE6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Wdr20Q3UWE6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Wdr20Q3UWE6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Wdr20Q3UWE6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Wdr20Q3UWE6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Wdr20Q3UWE6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Wdr20Q3UWE6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Wdr20Q3UWE6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Wdr20Q3UWE6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Wdr20Q3UWE6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Wdr20Q3UWE6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Wdr20Q3UWE6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Wdr20Q3UWE6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Wdr20Q3UWE6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Wdr20Q3UWE6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Wdr20Q3UWE6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Wdr20Q3UWE6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Wdr20Q3UWE6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Wdr20Q3UWE6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Wdr20Q3UWE6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Wdr20Q3UWE6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Wdr20Q3UWE6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Wdr20Q3UWE6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Wdr20Q3UWE6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Wdr20Q3UWE6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Wdr20Q3UWE6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Wdr20Q3UWE6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Wdr20Q3UWE6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Wdr20Q3UWE6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Wdr20Q3UWE6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Wdr20Q3UWE6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Wdr20Q3UWE6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Wdr20Q3UWE6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Wdr20Q3UWE6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Wdr20Q3UWE6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Wdr20Q3UWE6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Wdr20Q3UWE6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Wdr20Q3UWE6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Wdr20Q3UWE6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Wdr20Q3UWE6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Wdr20Q3UWE6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Wdr20Q3UWE6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Wdr20Q3UWE6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Wdr20Q3UWE6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Wdr20Q3UWE6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Wdr20Q3UWE6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Wdr20Q3UWE6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Wdr20Q3UWE6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Wdr20Q3UWE6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Wdr20Q3UWE6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Wdr20Q3UWE6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Wdr20Q3UWE6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Wdr20Q3UWE6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Wdr20Q3UWE6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Wdr20Q3UWE6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Wdr20Q3UWE6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Wdr20Q3UWE6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Wdr20Q3UWE6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Wdr20Q3UWE6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Wdr20Q3UWE6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Wdr20Q3UWE6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Wdr20Q3UWE6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Wdr20Q3UWE6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Wdr20Q3UWE6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Wdr20Q3UWE6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Wdr20Q3UWE6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Wdr20Q3UWE6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Wdr20Q3UWE6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Wdr20Q3UWE6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Wdr20Q3UWE6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Wdr20Q3UWE6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Wdr20Q3UWE6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms