Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW98

Clca4b, Chloride channel accessory 4B, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4bQ3UW98 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clca4bQ3UW98 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clca4bQ3UW98 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Clca4bQ3UW98 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clca4bQ3UW98 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clca4bQ3UW98 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clca4bQ3UW98 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clca4bQ3UW98 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clca4bQ3UW98 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clca4bQ3UW98 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Clca4bQ3UW98 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clca4bQ3UW98 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clca4bQ3UW98 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clca4bQ3UW98 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clca4bQ3UW98 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clca4bQ3UW98 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clca4bQ3UW98 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clca4bQ3UW98 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clca4bQ3UW98 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clca4bQ3UW98 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clca4bQ3UW98 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clca4bQ3UW98 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clca4bQ3UW98 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clca4bQ3UW98 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clca4bQ3UW98 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clca4bQ3UW98 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clca4bQ3UW98 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clca4bQ3UW98 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clca4bQ3UW98 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clca4bQ3UW98 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clca4bQ3UW98 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clca4bQ3UW98 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clca4bQ3UW98 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clca4bQ3UW98 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clca4bQ3UW98 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clca4bQ3UW98 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clca4bQ3UW98 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clca4bQ3UW98 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clca4bQ3UW98 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clca4bQ3UW98 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clca4bQ3UW98 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clca4bQ3UW98 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clca4bQ3UW98 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clca4bQ3UW98 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Clca4bQ3UW98 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clca4bQ3UW98 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clca4bQ3UW98 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clca4bQ3UW98 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clca4bQ3UW98 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Clca4bQ3UW98 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clca4bQ3UW98 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clca4bQ3UW98 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clca4bQ3UW98 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clca4bQ3UW98 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clca4bQ3UW98 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clca4bQ3UW98 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clca4bQ3UW98 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clca4bQ3UW98 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Clca4bQ3UW98 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clca4bQ3UW98 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clca4bQ3UW98 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Clca4bQ3UW98 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Clca4bQ3UW98 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clca4bQ3UW98 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clca4bQ3UW98 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clca4bQ3UW98 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clca4bQ3UW98 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clca4bQ3UW98 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clca4bQ3UW98 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clca4bQ3UW98 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clca4bQ3UW98 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clca4bQ3UW98 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clca4bQ3UW98 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clca4bQ3UW98 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clca4bQ3UW98 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clca4bQ3UW98 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clca4bQ3UW98 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clca4bQ3UW98 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clca4bQ3UW98 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clca4bQ3UW98 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clca4bQ3UW98 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clca4bQ3UW98 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clca4bQ3UW98 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clca4bQ3UW98 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clca4bQ3UW98 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clca4bQ3UW98 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clca4bQ3UW98 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Clca4bQ3UW98 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Clca4bQ3UW98 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clca4bQ3UW98 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clca4bQ3UW98 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clca4bQ3UW98 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clca4bQ3UW98 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clca4bQ3UW98 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clca4bQ3UW98 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Clca4bQ3UW98 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clca4bQ3UW98 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clca4bQ3UW98 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clca4bQ3UW98 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clca4bQ3UW98 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms