Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE1

Acsf3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsf3Q3URE1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Acsf3Q3URE1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Acsf3Q3URE1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Acsf3Q3URE1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Acsf3Q3URE1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Acsf3Q3URE1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Acsf3Q3URE1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Acsf3Q3URE1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Acsf3Q3URE1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Acsf3Q3URE1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Acsf3Q3URE1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Acsf3Q3URE1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Acsf3Q3URE1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Acsf3Q3URE1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Acsf3Q3URE1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Acsf3Q3URE1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Acsf3Q3URE1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Acsf3Q3URE1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Acsf3Q3URE1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Acsf3Q3URE1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Acsf3Q3URE1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Acsf3Q3URE1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Acsf3Q3URE1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Acsf3Q3URE1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Acsf3Q3URE1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Acsf3Q3URE1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Acsf3Q3URE1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Acsf3Q3URE1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Acsf3Q3URE1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Acsf3Q3URE1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Acsf3Q3URE1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Acsf3Q3URE1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Acsf3Q3URE1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Acsf3Q3URE1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Acsf3Q3URE1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Acsf3Q3URE1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Acsf3Q3URE1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Acsf3Q3URE1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Acsf3Q3URE1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Acsf3Q3URE1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Acsf3Q3URE1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Acsf3Q3URE1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Acsf3Q3URE1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Acsf3Q3URE1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Acsf3Q3URE1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Acsf3Q3URE1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Acsf3Q3URE1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Acsf3Q3URE1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Acsf3Q3URE1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Acsf3Q3URE1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Acsf3Q3URE1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Acsf3Q3URE1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Acsf3Q3URE1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Acsf3Q3URE1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Acsf3Q3URE1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Acsf3Q3URE1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Acsf3Q3URE1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Acsf3Q3URE1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Acsf3Q3URE1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Acsf3Q3URE1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Acsf3Q3URE1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Acsf3Q3URE1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Acsf3Q3URE1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Acsf3Q3URE1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Acsf3Q3URE1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Acsf3Q3URE1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Acsf3Q3URE1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Acsf3Q3URE1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Acsf3Q3URE1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Acsf3Q3URE1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Acsf3Q3URE1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Acsf3Q3URE1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Acsf3Q3URE1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Acsf3Q3URE1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Acsf3Q3URE1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Acsf3Q3URE1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Acsf3Q3URE1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Acsf3Q3URE1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Acsf3Q3URE1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Acsf3Q3URE1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Acsf3Q3URE1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Acsf3Q3URE1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Acsf3Q3URE1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Acsf3Q3URE1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Acsf3Q3URE1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Acsf3Q3URE1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Acsf3Q3URE1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Acsf3Q3URE1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Acsf3Q3URE1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Acsf3Q3URE1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Acsf3Q3URE1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Acsf3Q3URE1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Acsf3Q3URE1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Acsf3Q3URE1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Acsf3Q3URE1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Acsf3Q3URE1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Acsf3Q3URE1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Acsf3Q3URE1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Acsf3Q3URE1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Acsf3Q3URE1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms