Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL6

Ms4a15, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 15, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a15Q3UPL6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ms4a15Q3UPL6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ms4a15Q3UPL6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ms4a15Q3UPL6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ms4a15Q3UPL6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ms4a15Q3UPL6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ms4a15Q3UPL6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ms4a15Q3UPL6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ms4a15Q3UPL6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ms4a15Q3UPL6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ms4a15Q3UPL6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ms4a15Q3UPL6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ms4a15Q3UPL6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ms4a15Q3UPL6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ms4a15Q3UPL6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ms4a15Q3UPL6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ms4a15Q3UPL6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ms4a15Q3UPL6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ms4a15Q3UPL6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ms4a15Q3UPL6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ms4a15Q3UPL6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ms4a15Q3UPL6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ms4a15Q3UPL6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ms4a15Q3UPL6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ms4a15Q3UPL6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ms4a15Q3UPL6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ms4a15Q3UPL6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ms4a15Q3UPL6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ms4a15Q3UPL6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ms4a15Q3UPL6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ms4a15Q3UPL6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ms4a15Q3UPL6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ms4a15Q3UPL6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ms4a15Q3UPL6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ms4a15Q3UPL6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ms4a15Q3UPL6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ms4a15Q3UPL6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ms4a15Q3UPL6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ms4a15Q3UPL6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ms4a15Q3UPL6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ms4a15Q3UPL6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ms4a15Q3UPL6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ms4a15Q3UPL6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ms4a15Q3UPL6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ms4a15Q3UPL6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ms4a15Q3UPL6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ms4a15Q3UPL6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ms4a15Q3UPL6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ms4a15Q3UPL6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ms4a15Q3UPL6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ms4a15Q3UPL6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ms4a15Q3UPL6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ms4a15Q3UPL6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ms4a15Q3UPL6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ms4a15Q3UPL6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ms4a15Q3UPL6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ms4a15Q3UPL6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ms4a15Q3UPL6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ms4a15Q3UPL6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ms4a15Q3UPL6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ms4a15Q3UPL6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ms4a15Q3UPL6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ms4a15Q3UPL6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ms4a15Q3UPL6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ms4a15Q3UPL6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ms4a15Q3UPL6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ms4a15Q3UPL6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ms4a15Q3UPL6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ms4a15Q3UPL6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ms4a15Q3UPL6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ms4a15Q3UPL6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ms4a15Q3UPL6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ms4a15Q3UPL6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ms4a15Q3UPL6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ms4a15Q3UPL6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ms4a15Q3UPL6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ms4a15Q3UPL6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ms4a15Q3UPL6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ms4a15Q3UPL6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ms4a15Q3UPL6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ms4a15Q3UPL6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ms4a15Q3UPL6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ms4a15Q3UPL6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ms4a15Q3UPL6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ms4a15Q3UPL6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ms4a15Q3UPL6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ms4a15Q3UPL6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ms4a15Q3UPL6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ms4a15Q3UPL6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ms4a15Q3UPL6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ms4a15Q3UPL6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ms4a15Q3UPL6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ms4a15Q3UPL6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ms4a15Q3UPL6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ms4a15Q3UPL6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ms4a15Q3UPL6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ms4a15Q3UPL6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ms4a15Q3UPL6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ms4a15Q3UPL6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ms4a15Q3UPL6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.2 ms