Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Q3UPC7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Q3UPC7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Q3UPC7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Q3UPC7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Q3UPC7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Q3UPC7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Q3UPC7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Q3UPC7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Q3UPC7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Q3UPC7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Q3UPC7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Q3UPC7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Q3UPC7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Q3UPC7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Q3UPC7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Q3UPC7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Q3UPC7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Q3UPC7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Q3UPC7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Q3UPC7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Q3UPC7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Q3UPC7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Q3UPC7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Q3UPC7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Q3UPC7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Q3UPC7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Q3UPC7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Q3UPC7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Q3UPC7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Q3UPC7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Q3UPC7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Q3UPC7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Q3UPC7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Q3UPC7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Q3UPC7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Q3UPC7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Q3UPC7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Q3UPC7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Q3UPC7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Q3UPC7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Q3UPC7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Q3UPC7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Q3UPC7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Q3UPC7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Q3UPC7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Q3UPC7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Q3UPC7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Q3UPC7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Q3UPC7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Q3UPC7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Q3UPC7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Q3UPC7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Q3UPC7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Q3UPC7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Q3UPC7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Q3UPC7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Q3UPC7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Q3UPC7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Q3UPC7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Q3UPC7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Q3UPC7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Q3UPC7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Q3UPC7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Q3UPC7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Q3UPC7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Q3UPC7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Q3UPC7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Q3UPC7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Q3UPC7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Q3UPC7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Q3UPC7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Q3UPC7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Q3UPC7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Q3UPC7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Q3UPC7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Q3UPC7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Q3UPC7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Q3UPC7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Q3UPC7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Q3UPC7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Q3UPC7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Q3UPC7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Q3UPC7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Q3UPC7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Q3UPC7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Q3UPC7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Q3UPC7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Q3UPC7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Q3UPC7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Q3UPC7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Q3UPC7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Q3UPC7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Q3UPC7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Q3UPC7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Q3UPC7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Q3UPC7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Q3UPC7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Q3UPC7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Q3UPC7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms