Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP38

Cracr2a, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2aQ3UP38 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Cracr2aQ3UP38 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cracr2aQ3UP38 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cracr2aQ3UP38 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cracr2aQ3UP38 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cracr2aQ3UP38 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cracr2aQ3UP38 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cracr2aQ3UP38 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Cracr2aQ3UP38 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cracr2aQ3UP38 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cracr2aQ3UP38 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cracr2aQ3UP38 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cracr2aQ3UP38 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cracr2aQ3UP38 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cracr2aQ3UP38 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cracr2aQ3UP38 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cracr2aQ3UP38 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cracr2aQ3UP38 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cracr2aQ3UP38 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cracr2aQ3UP38 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cracr2aQ3UP38 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cracr2aQ3UP38 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cracr2aQ3UP38 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cracr2aQ3UP38 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cracr2aQ3UP38 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cracr2aQ3UP38 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cracr2aQ3UP38 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cracr2aQ3UP38 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cracr2aQ3UP38 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cracr2aQ3UP38 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cracr2aQ3UP38 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cracr2aQ3UP38 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cracr2aQ3UP38 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cracr2aQ3UP38 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cracr2aQ3UP38 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cracr2aQ3UP38 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Cracr2aQ3UP38 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cracr2aQ3UP38 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cracr2aQ3UP38 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Cracr2aQ3UP38 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cracr2aQ3UP38 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cracr2aQ3UP38 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cracr2aQ3UP38 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cracr2aQ3UP38 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cracr2aQ3UP38 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cracr2aQ3UP38 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cracr2aQ3UP38 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cracr2aQ3UP38 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cracr2aQ3UP38 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cracr2aQ3UP38 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cracr2aQ3UP38 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cracr2aQ3UP38 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cracr2aQ3UP38 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cracr2aQ3UP38 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cracr2aQ3UP38 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cracr2aQ3UP38 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cracr2aQ3UP38 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cracr2aQ3UP38 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cracr2aQ3UP38 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cracr2aQ3UP38 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cracr2aQ3UP38 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cracr2aQ3UP38 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cracr2aQ3UP38 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cracr2aQ3UP38 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cracr2aQ3UP38 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cracr2aQ3UP38 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cracr2aQ3UP38 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Cracr2aQ3UP38 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cracr2aQ3UP38 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cracr2aQ3UP38 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cracr2aQ3UP38 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cracr2aQ3UP38 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cracr2aQ3UP38 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cracr2aQ3UP38 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cracr2aQ3UP38 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cracr2aQ3UP38 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cracr2aQ3UP38 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cracr2aQ3UP38 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cracr2aQ3UP38 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cracr2aQ3UP38 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cracr2aQ3UP38 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cracr2aQ3UP38 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cracr2aQ3UP38 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Cracr2aQ3UP38 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cracr2aQ3UP38 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cracr2aQ3UP38 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cracr2aQ3UP38 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cracr2aQ3UP38 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cracr2aQ3UP38 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cracr2aQ3UP38 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Cracr2aQ3UP38 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cracr2aQ3UP38 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cracr2aQ3UP38 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cracr2aQ3UP38 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cracr2aQ3UP38 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cracr2aQ3UP38 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cracr2aQ3UP38 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cracr2aQ3UP38 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cracr2aQ3UP38 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cracr2aQ3UP38 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms