Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMR0

Ankrd27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd27Q3UMR0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ankrd27Q3UMR0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ankrd27Q3UMR0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ankrd27Q3UMR0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ankrd27Q3UMR0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ankrd27Q3UMR0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ankrd27Q3UMR0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ankrd27Q3UMR0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ankrd27Q3UMR0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ankrd27Q3UMR0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ankrd27Q3UMR0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ankrd27Q3UMR0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ankrd27Q3UMR0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ankrd27Q3UMR0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ankrd27Q3UMR0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ankrd27Q3UMR0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ankrd27Q3UMR0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ankrd27Q3UMR0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ankrd27Q3UMR0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ankrd27Q3UMR0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ankrd27Q3UMR0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ankrd27Q3UMR0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ankrd27Q3UMR0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ankrd27Q3UMR0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ankrd27Q3UMR0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ankrd27Q3UMR0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ankrd27Q3UMR0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ankrd27Q3UMR0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ankrd27Q3UMR0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ankrd27Q3UMR0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ankrd27Q3UMR0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ankrd27Q3UMR0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ankrd27Q3UMR0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ankrd27Q3UMR0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ankrd27Q3UMR0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ankrd27Q3UMR0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ankrd27Q3UMR0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ankrd27Q3UMR0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ankrd27Q3UMR0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ankrd27Q3UMR0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ankrd27Q3UMR0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ankrd27Q3UMR0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ankrd27Q3UMR0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ankrd27Q3UMR0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ankrd27Q3UMR0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ankrd27Q3UMR0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ankrd27Q3UMR0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ankrd27Q3UMR0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ankrd27Q3UMR0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ankrd27Q3UMR0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ankrd27Q3UMR0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ankrd27Q3UMR0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ankrd27Q3UMR0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ankrd27Q3UMR0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ankrd27Q3UMR0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ankrd27Q3UMR0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ankrd27Q3UMR0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ankrd27Q3UMR0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ankrd27Q3UMR0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ankrd27Q3UMR0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ankrd27Q3UMR0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ankrd27Q3UMR0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ankrd27Q3UMR0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ankrd27Q3UMR0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ankrd27Q3UMR0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ankrd27Q3UMR0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ankrd27Q3UMR0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ankrd27Q3UMR0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ankrd27Q3UMR0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ankrd27Q3UMR0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ankrd27Q3UMR0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ankrd27Q3UMR0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ankrd27Q3UMR0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ankrd27Q3UMR0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ankrd27Q3UMR0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ankrd27Q3UMR0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ankrd27Q3UMR0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ankrd27Q3UMR0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ankrd27Q3UMR0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ankrd27Q3UMR0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ankrd27Q3UMR0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ankrd27Q3UMR0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ankrd27Q3UMR0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ankrd27Q3UMR0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ankrd27Q3UMR0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ankrd27Q3UMR0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ankrd27Q3UMR0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ankrd27Q3UMR0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ankrd27Q3UMR0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ankrd27Q3UMR0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ankrd27Q3UMR0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ankrd27Q3UMR0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ankrd27Q3UMR0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ankrd27Q3UMR0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ankrd27Q3UMR0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ankrd27Q3UMR0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ankrd27Q3UMR0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ankrd27Q3UMR0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ankrd27Q3UMR0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ankrd27Q3UMR0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms