Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cobll1Q3UMF0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cobll1Q3UMF0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cobll1Q3UMF0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cobll1Q3UMF0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cobll1Q3UMF0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cobll1Q3UMF0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cobll1Q3UMF0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cobll1Q3UMF0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cobll1Q3UMF0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cobll1Q3UMF0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cobll1Q3UMF0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cobll1Q3UMF0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cobll1Q3UMF0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cobll1Q3UMF0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cobll1Q3UMF0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cobll1Q3UMF0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cobll1Q3UMF0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cobll1Q3UMF0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cobll1Q3UMF0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cobll1Q3UMF0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cobll1Q3UMF0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cobll1Q3UMF0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cobll1Q3UMF0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cobll1Q3UMF0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cobll1Q3UMF0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cobll1Q3UMF0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cobll1Q3UMF0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cobll1Q3UMF0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cobll1Q3UMF0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cobll1Q3UMF0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cobll1Q3UMF0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cobll1Q3UMF0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cobll1Q3UMF0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cobll1Q3UMF0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cobll1Q3UMF0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cobll1Q3UMF0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cobll1Q3UMF0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cobll1Q3UMF0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cobll1Q3UMF0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cobll1Q3UMF0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cobll1Q3UMF0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cobll1Q3UMF0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cobll1Q3UMF0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cobll1Q3UMF0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cobll1Q3UMF0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cobll1Q3UMF0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cobll1Q3UMF0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cobll1Q3UMF0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cobll1Q3UMF0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cobll1Q3UMF0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cobll1Q3UMF0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cobll1Q3UMF0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cobll1Q3UMF0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cobll1Q3UMF0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cobll1Q3UMF0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cobll1Q3UMF0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cobll1Q3UMF0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cobll1Q3UMF0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cobll1Q3UMF0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cobll1Q3UMF0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cobll1Q3UMF0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cobll1Q3UMF0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cobll1Q3UMF0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cobll1Q3UMF0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cobll1Q3UMF0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cobll1Q3UMF0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cobll1Q3UMF0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cobll1Q3UMF0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cobll1Q3UMF0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cobll1Q3UMF0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cobll1Q3UMF0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cobll1Q3UMF0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cobll1Q3UMF0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cobll1Q3UMF0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cobll1Q3UMF0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cobll1Q3UMF0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cobll1Q3UMF0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cobll1Q3UMF0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cobll1Q3UMF0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cobll1Q3UMF0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cobll1Q3UMF0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cobll1Q3UMF0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cobll1Q3UMF0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cobll1Q3UMF0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cobll1Q3UMF0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cobll1Q3UMF0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cobll1Q3UMF0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cobll1Q3UMF0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cobll1Q3UMF0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cobll1Q3UMF0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cobll1Q3UMF0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cobll1Q3UMF0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cobll1Q3UMF0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cobll1Q3UMF0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cobll1Q3UMF0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cobll1Q3UMF0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cobll1Q3UMF0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cobll1Q3UMF0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cobll1Q3UMF0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms