Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cog7Q3UM29 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cog7Q3UM29 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cog7Q3UM29 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cog7Q3UM29 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cog7Q3UM29 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cog7Q3UM29 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cog7Q3UM29 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cog7Q3UM29 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cog7Q3UM29 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Cog7Q3UM29 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cog7Q3UM29 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Cog7Q3UM29 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cog7Q3UM29 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cog7Q3UM29 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cog7Q3UM29 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cog7Q3UM29 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cog7Q3UM29 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cog7Q3UM29 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cog7Q3UM29 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cog7Q3UM29 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cog7Q3UM29 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cog7Q3UM29 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cog7Q3UM29 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cog7Q3UM29 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cog7Q3UM29 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Cog7Q3UM29 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cog7Q3UM29 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cog7Q3UM29 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cog7Q3UM29 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cog7Q3UM29 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cog7Q3UM29 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cog7Q3UM29 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cog7Q3UM29 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cog7Q3UM29 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cog7Q3UM29 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cog7Q3UM29 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cog7Q3UM29 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cog7Q3UM29 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cog7Q3UM29 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cog7Q3UM29 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cog7Q3UM29 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cog7Q3UM29 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cog7Q3UM29 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cog7Q3UM29 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cog7Q3UM29 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cog7Q3UM29 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cog7Q3UM29 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cog7Q3UM29 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cog7Q3UM29 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cog7Q3UM29 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cog7Q3UM29 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cog7Q3UM29 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cog7Q3UM29 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cog7Q3UM29 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cog7Q3UM29 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cog7Q3UM29 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cog7Q3UM29 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cog7Q3UM29 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cog7Q3UM29 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cog7Q3UM29 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cog7Q3UM29 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cog7Q3UM29 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cog7Q3UM29 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cog7Q3UM29 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cog7Q3UM29 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cog7Q3UM29 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cog7Q3UM29 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cog7Q3UM29 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cog7Q3UM29 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cog7Q3UM29 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cog7Q3UM29 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cog7Q3UM29 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cog7Q3UM29 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cog7Q3UM29 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cog7Q3UM29 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cog7Q3UM29 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cog7Q3UM29 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cog7Q3UM29 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cog7Q3UM29 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cog7Q3UM29 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cog7Q3UM29 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cog7Q3UM29 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cog7Q3UM29 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cog7Q3UM29 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cog7Q3UM29 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cog7Q3UM29 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cog7Q3UM29 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cog7Q3UM29 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cog7Q3UM29 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cog7Q3UM29 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cog7Q3UM29 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cog7Q3UM29 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cog7Q3UM29 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cog7Q3UM29 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cog7Q3UM29 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cog7Q3UM29 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cog7Q3UM29 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cog7Q3UM29 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cog7Q3UM29 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms