Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc33Q3ULW6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc33Q3ULW6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc33Q3ULW6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc33Q3ULW6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc33Q3ULW6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc33Q3ULW6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc33Q3ULW6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc33Q3ULW6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc33Q3ULW6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc33Q3ULW6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc33Q3ULW6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc33Q3ULW6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc33Q3ULW6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc33Q3ULW6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc33Q3ULW6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc33Q3ULW6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc33Q3ULW6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc33Q3ULW6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc33Q3ULW6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc33Q3ULW6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc33Q3ULW6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc33Q3ULW6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc33Q3ULW6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc33Q3ULW6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc33Q3ULW6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc33Q3ULW6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc33Q3ULW6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc33Q3ULW6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc33Q3ULW6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc33Q3ULW6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccdc33Q3ULW6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccdc33Q3ULW6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc33Q3ULW6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc33Q3ULW6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc33Q3ULW6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc33Q3ULW6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc33Q3ULW6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc33Q3ULW6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc33Q3ULW6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc33Q3ULW6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc33Q3ULW6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc33Q3ULW6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc33Q3ULW6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc33Q3ULW6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc33Q3ULW6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc33Q3ULW6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc33Q3ULW6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc33Q3ULW6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc33Q3ULW6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc33Q3ULW6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc33Q3ULW6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc33Q3ULW6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc33Q3ULW6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc33Q3ULW6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc33Q3ULW6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc33Q3ULW6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc33Q3ULW6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc33Q3ULW6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc33Q3ULW6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc33Q3ULW6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc33Q3ULW6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc33Q3ULW6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc33Q3ULW6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc33Q3ULW6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc33Q3ULW6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc33Q3ULW6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc33Q3ULW6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc33Q3ULW6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc33Q3ULW6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc33Q3ULW6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc33Q3ULW6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc33Q3ULW6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc33Q3ULW6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc33Q3ULW6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc33Q3ULW6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc33Q3ULW6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc33Q3ULW6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc33Q3ULW6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc33Q3ULW6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc33Q3ULW6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc33Q3ULW6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc33Q3ULW6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc33Q3ULW6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc33Q3ULW6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc33Q3ULW6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc33Q3ULW6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc33Q3ULW6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc33Q3ULW6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc33Q3ULW6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc33Q3ULW6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc33Q3ULW6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc33Q3ULW6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc33Q3ULW6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc33Q3ULW6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc33Q3ULW6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc33Q3ULW6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc33Q3ULW6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc33Q3ULW6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms