Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CrxosQ3UL53 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CrxosQ3UL53 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CrxosQ3UL53 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CrxosQ3UL53 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CrxosQ3UL53 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CrxosQ3UL53 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CrxosQ3UL53 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CrxosQ3UL53 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CrxosQ3UL53 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CrxosQ3UL53 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CrxosQ3UL53 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CrxosQ3UL53 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CrxosQ3UL53 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CrxosQ3UL53 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CrxosQ3UL53 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CrxosQ3UL53 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CrxosQ3UL53 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CrxosQ3UL53 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CrxosQ3UL53 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CrxosQ3UL53 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CrxosQ3UL53 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CrxosQ3UL53 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CrxosQ3UL53 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CrxosQ3UL53 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CrxosQ3UL53 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CrxosQ3UL53 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CrxosQ3UL53 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CrxosQ3UL53 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CrxosQ3UL53 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CrxosQ3UL53 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CrxosQ3UL53 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CrxosQ3UL53 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CrxosQ3UL53 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CrxosQ3UL53 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CrxosQ3UL53 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CrxosQ3UL53 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CrxosQ3UL53 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CrxosQ3UL53 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CrxosQ3UL53 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CrxosQ3UL53 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CrxosQ3UL53 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CrxosQ3UL53 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CrxosQ3UL53 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CrxosQ3UL53 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CrxosQ3UL53 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CrxosQ3UL53 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CrxosQ3UL53 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CrxosQ3UL53 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CrxosQ3UL53 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CrxosQ3UL53 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CrxosQ3UL53 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CrxosQ3UL53 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CrxosQ3UL53 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CrxosQ3UL53 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CrxosQ3UL53 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CrxosQ3UL53 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CrxosQ3UL53 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CrxosQ3UL53 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CrxosQ3UL53 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CrxosQ3UL53 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CrxosQ3UL53 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CrxosQ3UL53 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CrxosQ3UL53 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CrxosQ3UL53 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CrxosQ3UL53 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CrxosQ3UL53 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CrxosQ3UL53 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CrxosQ3UL53 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CrxosQ3UL53 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CrxosQ3UL53 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CrxosQ3UL53 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CrxosQ3UL53 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CrxosQ3UL53 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CrxosQ3UL53 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CrxosQ3UL53 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CrxosQ3UL53 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CrxosQ3UL53 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CrxosQ3UL53 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CrxosQ3UL53 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CrxosQ3UL53 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CrxosQ3UL53 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CrxosQ3UL53 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CrxosQ3UL53 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CrxosQ3UL53 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CrxosQ3UL53 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CrxosQ3UL53 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CrxosQ3UL53 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CrxosQ3UL53 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CrxosQ3UL53 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CrxosQ3UL53 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CrxosQ3UL53 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CrxosQ3UL53 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CrxosQ3UL53 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CrxosQ3UL53 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CrxosQ3UL53 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CrxosQ3UL53 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CrxosQ3UL53 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CrxosQ3UL53 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CrxosQ3UL53 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms