Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGS4

Mcrip1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcrip1Q3UGS4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mcrip1Q3UGS4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mcrip1Q3UGS4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mcrip1Q3UGS4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mcrip1Q3UGS4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mcrip1Q3UGS4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mcrip1Q3UGS4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mcrip1Q3UGS4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mcrip1Q3UGS4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mcrip1Q3UGS4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mcrip1Q3UGS4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mcrip1Q3UGS4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mcrip1Q3UGS4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mcrip1Q3UGS4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mcrip1Q3UGS4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mcrip1Q3UGS4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Mcrip1Q3UGS4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mcrip1Q3UGS4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mcrip1Q3UGS4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mcrip1Q3UGS4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mcrip1Q3UGS4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mcrip1Q3UGS4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mcrip1Q3UGS4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mcrip1Q3UGS4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mcrip1Q3UGS4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mcrip1Q3UGS4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mcrip1Q3UGS4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mcrip1Q3UGS4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mcrip1Q3UGS4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mcrip1Q3UGS4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mcrip1Q3UGS4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mcrip1Q3UGS4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Mcrip1Q3UGS4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mcrip1Q3UGS4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mcrip1Q3UGS4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mcrip1Q3UGS4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Mcrip1Q3UGS4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mcrip1Q3UGS4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mcrip1Q3UGS4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mcrip1Q3UGS4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mcrip1Q3UGS4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mcrip1Q3UGS4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mcrip1Q3UGS4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mcrip1Q3UGS4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Mcrip1Q3UGS4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mcrip1Q3UGS4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mcrip1Q3UGS4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mcrip1Q3UGS4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mcrip1Q3UGS4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mcrip1Q3UGS4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mcrip1Q3UGS4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Mcrip1Q3UGS4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mcrip1Q3UGS4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mcrip1Q3UGS4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mcrip1Q3UGS4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mcrip1Q3UGS4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mcrip1Q3UGS4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mcrip1Q3UGS4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mcrip1Q3UGS4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mcrip1Q3UGS4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mcrip1Q3UGS4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mcrip1Q3UGS4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mcrip1Q3UGS4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mcrip1Q3UGS4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mcrip1Q3UGS4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mcrip1Q3UGS4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mcrip1Q3UGS4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mcrip1Q3UGS4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mcrip1Q3UGS4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mcrip1Q3UGS4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mcrip1Q3UGS4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mcrip1Q3UGS4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mcrip1Q3UGS4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mcrip1Q3UGS4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mcrip1Q3UGS4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mcrip1Q3UGS4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mcrip1Q3UGS4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mcrip1Q3UGS4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mcrip1Q3UGS4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mcrip1Q3UGS4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mcrip1Q3UGS4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mcrip1Q3UGS4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mcrip1Q3UGS4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mcrip1Q3UGS4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Mcrip1Q3UGS4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mcrip1Q3UGS4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mcrip1Q3UGS4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mcrip1Q3UGS4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mcrip1Q3UGS4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Mcrip1Q3UGS4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mcrip1Q3UGS4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mcrip1Q3UGS4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mcrip1Q3UGS4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mcrip1Q3UGS4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mcrip1Q3UGS4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mcrip1Q3UGS4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mcrip1Q3UGS4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mcrip1Q3UGS4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mcrip1Q3UGS4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mcrip1Q3UGS4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms