Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGR5

Hdhd2, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Hdhd2Q3UGR5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hdhd2Q3UGR5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hdhd2Q3UGR5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Hdhd2Q3UGR5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
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Hdhd2Q3UGR5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hdhd2Q3UGR5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hdhd2Q3UGR5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hdhd2Q3UGR5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hdhd2Q3UGR5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hdhd2Q3UGR5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hdhd2Q3UGR5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
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Hdhd2Q3UGR5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hdhd2Q3UGR5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hdhd2Q3UGR5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hdhd2Q3UGR5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hdhd2Q3UGR5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hdhd2Q3UGR5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hdhd2Q3UGR5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
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Hdhd2Q3UGR5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hdhd2Q3UGR5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hdhd2Q3UGR5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hdhd2Q3UGR5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Hdhd2Q3UGR5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hdhd2Q3UGR5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hdhd2Q3UGR5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hdhd2Q3UGR5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
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Hdhd2Q3UGR5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
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Hdhd2Q3UGR5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
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Hdhd2Q3UGR5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
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Hdhd2Q3UGR5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hdhd2Q3UGR5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hdhd2Q3UGR5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hdhd2Q3UGR5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
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Hdhd2Q3UGR5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
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Hdhd2Q3UGR5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
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Hdhd2Q3UGR5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hdhd2Q3UGR5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hdhd2Q3UGR5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
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Hdhd2Q3UGR5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hdhd2Q3UGR5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hdhd2Q3UGR5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hdhd2Q3UGR5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hdhd2Q3UGR5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
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Hdhd2Q3UGR5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hdhd2Q3UGR5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hdhd2Q3UGR5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hdhd2Q3UGR5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hdhd2Q3UGR5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hdhd2Q3UGR5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hdhd2Q3UGR5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hdhd2Q3UGR5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hdhd2Q3UGR5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hdhd2Q3UGR5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hdhd2Q3UGR5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hdhd2Q3UGR5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hdhd2Q3UGR5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Hdhd2Q3UGR5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Hdhd2Q3UGR5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hdhd2Q3UGR5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hdhd2Q3UGR5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms