Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGR5

Hdhd2, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd2Q3UGR5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hdhd2Q3UGR5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hdhd2Q3UGR5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Hdhd2Q3UGR5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hdhd2Q3UGR5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hdhd2Q3UGR5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Hdhd2Q3UGR5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hdhd2Q3UGR5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hdhd2Q3UGR5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hdhd2Q3UGR5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hdhd2Q3UGR5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hdhd2Q3UGR5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hdhd2Q3UGR5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hdhd2Q3UGR5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hdhd2Q3UGR5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hdhd2Q3UGR5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hdhd2Q3UGR5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hdhd2Q3UGR5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hdhd2Q3UGR5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hdhd2Q3UGR5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hdhd2Q3UGR5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hdhd2Q3UGR5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hdhd2Q3UGR5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hdhd2Q3UGR5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hdhd2Q3UGR5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hdhd2Q3UGR5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hdhd2Q3UGR5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hdhd2Q3UGR5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hdhd2Q3UGR5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hdhd2Q3UGR5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hdhd2Q3UGR5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hdhd2Q3UGR5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Hdhd2Q3UGR5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hdhd2Q3UGR5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hdhd2Q3UGR5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hdhd2Q3UGR5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hdhd2Q3UGR5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hdhd2Q3UGR5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hdhd2Q3UGR5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hdhd2Q3UGR5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hdhd2Q3UGR5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hdhd2Q3UGR5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Hdhd2Q3UGR5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Hdhd2Q3UGR5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hdhd2Q3UGR5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hdhd2Q3UGR5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Hdhd2Q3UGR5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hdhd2Q3UGR5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hdhd2Q3UGR5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hdhd2Q3UGR5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hdhd2Q3UGR5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hdhd2Q3UGR5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hdhd2Q3UGR5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hdhd2Q3UGR5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hdhd2Q3UGR5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hdhd2Q3UGR5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hdhd2Q3UGR5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hdhd2Q3UGR5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hdhd2Q3UGR5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hdhd2Q3UGR5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hdhd2Q3UGR5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hdhd2Q3UGR5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hdhd2Q3UGR5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hdhd2Q3UGR5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hdhd2Q3UGR5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hdhd2Q3UGR5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hdhd2Q3UGR5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hdhd2Q3UGR5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hdhd2Q3UGR5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hdhd2Q3UGR5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hdhd2Q3UGR5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hdhd2Q3UGR5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hdhd2Q3UGR5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hdhd2Q3UGR5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hdhd2Q3UGR5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hdhd2Q3UGR5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hdhd2Q3UGR5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Hdhd2Q3UGR5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hdhd2Q3UGR5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hdhd2Q3UGR5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hdhd2Q3UGR5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hdhd2Q3UGR5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hdhd2Q3UGR5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hdhd2Q3UGR5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hdhd2Q3UGR5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hdhd2Q3UGR5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hdhd2Q3UGR5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hdhd2Q3UGR5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hdhd2Q3UGR5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hdhd2Q3UGR5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hdhd2Q3UGR5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hdhd2Q3UGR5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hdhd2Q3UGR5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hdhd2Q3UGR5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hdhd2Q3UGR5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hdhd2Q3UGR5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Hdhd2Q3UGR5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Hdhd2Q3UGR5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hdhd2Q3UGR5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hdhd2Q3UGR5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms