Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDE2

Ttll12, Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll12Q3UDE2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ttll12Q3UDE2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ttll12Q3UDE2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ttll12Q3UDE2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ttll12Q3UDE2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ttll12Q3UDE2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ttll12Q3UDE2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ttll12Q3UDE2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Ttll12Q3UDE2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ttll12Q3UDE2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ttll12Q3UDE2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ttll12Q3UDE2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ttll12Q3UDE2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ttll12Q3UDE2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ttll12Q3UDE2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ttll12Q3UDE2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ttll12Q3UDE2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ttll12Q3UDE2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ttll12Q3UDE2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ttll12Q3UDE2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ttll12Q3UDE2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ttll12Q3UDE2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ttll12Q3UDE2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ttll12Q3UDE2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ttll12Q3UDE2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ttll12Q3UDE2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ttll12Q3UDE2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ttll12Q3UDE2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ttll12Q3UDE2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ttll12Q3UDE2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ttll12Q3UDE2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Ttll12Q3UDE2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ttll12Q3UDE2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ttll12Q3UDE2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ttll12Q3UDE2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ttll12Q3UDE2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ttll12Q3UDE2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ttll12Q3UDE2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Ttll12Q3UDE2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ttll12Q3UDE2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ttll12Q3UDE2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Ttll12Q3UDE2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ttll12Q3UDE2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ttll12Q3UDE2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ttll12Q3UDE2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ttll12Q3UDE2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ttll12Q3UDE2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ttll12Q3UDE2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ttll12Q3UDE2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ttll12Q3UDE2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ttll12Q3UDE2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ttll12Q3UDE2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ttll12Q3UDE2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ttll12Q3UDE2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ttll12Q3UDE2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Ttll12Q3UDE2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ttll12Q3UDE2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ttll12Q3UDE2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ttll12Q3UDE2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ttll12Q3UDE2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ttll12Q3UDE2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Ttll12Q3UDE2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Ttll12Q3UDE2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ttll12Q3UDE2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ttll12Q3UDE2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ttll12Q3UDE2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ttll12Q3UDE2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ttll12Q3UDE2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ttll12Q3UDE2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ttll12Q3UDE2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Ttll12Q3UDE2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ttll12Q3UDE2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Ttll12Q3UDE2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Ttll12Q3UDE2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ttll12Q3UDE2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Ttll12Q3UDE2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ttll12Q3UDE2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ttll12Q3UDE2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ttll12Q3UDE2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ttll12Q3UDE2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ttll12Q3UDE2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ttll12Q3UDE2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ttll12Q3UDE2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ttll12Q3UDE2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ttll12Q3UDE2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ttll12Q3UDE2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ttll12Q3UDE2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ttll12Q3UDE2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ttll12Q3UDE2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ttll12Q3UDE2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ttll12Q3UDE2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ttll12Q3UDE2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ttll12Q3UDE2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Ttll12Q3UDE2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Ttll12Q3UDE2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ttll12Q3UDE2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ttll12Q3UDE2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ttll12Q3UDE2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ttll12Q3UDE2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ttll12Q3UDE2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms