Protein–RNA interactions for Protein: Q3U308

Ctu2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu2Q3U308 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctu2Q3U308 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctu2Q3U308 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctu2Q3U308 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctu2Q3U308 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctu2Q3U308 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctu2Q3U308 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctu2Q3U308 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctu2Q3U308 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctu2Q3U308 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctu2Q3U308 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctu2Q3U308 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctu2Q3U308 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctu2Q3U308 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctu2Q3U308 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctu2Q3U308 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ctu2Q3U308 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctu2Q3U308 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctu2Q3U308 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctu2Q3U308 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctu2Q3U308 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctu2Q3U308 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctu2Q3U308 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctu2Q3U308 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctu2Q3U308 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctu2Q3U308 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctu2Q3U308 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctu2Q3U308 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctu2Q3U308 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctu2Q3U308 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctu2Q3U308 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctu2Q3U308 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctu2Q3U308 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctu2Q3U308 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctu2Q3U308 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctu2Q3U308 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctu2Q3U308 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctu2Q3U308 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctu2Q3U308 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctu2Q3U308 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctu2Q3U308 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctu2Q3U308 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctu2Q3U308 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctu2Q3U308 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctu2Q3U308 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctu2Q3U308 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctu2Q3U308 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctu2Q3U308 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctu2Q3U308 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctu2Q3U308 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctu2Q3U308 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctu2Q3U308 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctu2Q3U308 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctu2Q3U308 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctu2Q3U308 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctu2Q3U308 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctu2Q3U308 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctu2Q3U308 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctu2Q3U308 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctu2Q3U308 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctu2Q3U308 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctu2Q3U308 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctu2Q3U308 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctu2Q3U308 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctu2Q3U308 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctu2Q3U308 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctu2Q3U308 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctu2Q3U308 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctu2Q3U308 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctu2Q3U308 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctu2Q3U308 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctu2Q3U308 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctu2Q3U308 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctu2Q3U308 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctu2Q3U308 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctu2Q3U308 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctu2Q3U308 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctu2Q3U308 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctu2Q3U308 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctu2Q3U308 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctu2Q3U308 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctu2Q3U308 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctu2Q3U308 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctu2Q3U308 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctu2Q3U308 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctu2Q3U308 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ctu2Q3U308 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctu2Q3U308 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctu2Q3U308 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctu2Q3U308 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctu2Q3U308 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctu2Q3U308 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctu2Q3U308 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctu2Q3U308 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctu2Q3U308 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctu2Q3U308 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctu2Q3U308 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctu2Q3U308 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctu2Q3U308 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctu2Q3U308 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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