Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf149Q3U2C5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf149Q3U2C5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf149Q3U2C5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf149Q3U2C5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf149Q3U2C5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf149Q3U2C5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf149Q3U2C5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf149Q3U2C5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf149Q3U2C5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf149Q3U2C5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf149Q3U2C5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf149Q3U2C5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf149Q3U2C5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf149Q3U2C5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf149Q3U2C5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf149Q3U2C5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf149Q3U2C5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf149Q3U2C5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf149Q3U2C5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf149Q3U2C5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf149Q3U2C5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf149Q3U2C5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf149Q3U2C5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf149Q3U2C5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf149Q3U2C5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf149Q3U2C5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf149Q3U2C5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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Rnf149Q3U2C5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf149Q3U2C5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rnf149Q3U2C5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rnf149Q3U2C5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf149Q3U2C5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf149Q3U2C5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf149Q3U2C5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf149Q3U2C5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf149Q3U2C5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf149Q3U2C5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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Rnf149Q3U2C5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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Rnf149Q3U2C5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf149Q3U2C5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf149Q3U2C5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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Rnf149Q3U2C5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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Rnf149Q3U2C5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf149Q3U2C5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf149Q3U2C5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf149Q3U2C5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf149Q3U2C5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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Rnf149Q3U2C5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
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Rnf149Q3U2C5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnf149Q3U2C5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnf149Q3U2C5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnf149Q3U2C5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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Rnf149Q3U2C5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rnf149Q3U2C5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rnf149Q3U2C5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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Rnf149Q3U2C5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rnf149Q3U2C5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf149Q3U2C5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rnf149Q3U2C5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnf149Q3U2C5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnf149Q3U2C5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnf149Q3U2C5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf149Q3U2C5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf149Q3U2C5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf149Q3U2C5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf149Q3U2C5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf149Q3U2C5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
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Rnf149Q3U2C5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rnf149Q3U2C5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rnf149Q3U2C5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rnf149Q3U2C5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Rnf149Q3U2C5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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