Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1T3

Brms1l, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1lQ3U1T3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Brms1lQ3U1T3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Brms1lQ3U1T3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Brms1lQ3U1T3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Brms1lQ3U1T3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Brms1lQ3U1T3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Brms1lQ3U1T3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Brms1lQ3U1T3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Brms1lQ3U1T3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Brms1lQ3U1T3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Brms1lQ3U1T3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Brms1lQ3U1T3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Brms1lQ3U1T3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Brms1lQ3U1T3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Brms1lQ3U1T3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Brms1lQ3U1T3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Brms1lQ3U1T3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Brms1lQ3U1T3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Brms1lQ3U1T3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Brms1lQ3U1T3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Brms1lQ3U1T3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Brms1lQ3U1T3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Brms1lQ3U1T3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Brms1lQ3U1T3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Brms1lQ3U1T3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Brms1lQ3U1T3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Brms1lQ3U1T3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Brms1lQ3U1T3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Brms1lQ3U1T3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Brms1lQ3U1T3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Brms1lQ3U1T3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Brms1lQ3U1T3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Brms1lQ3U1T3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Brms1lQ3U1T3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Brms1lQ3U1T3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Brms1lQ3U1T3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Brms1lQ3U1T3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Brms1lQ3U1T3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Brms1lQ3U1T3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Brms1lQ3U1T3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Brms1lQ3U1T3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Brms1lQ3U1T3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Brms1lQ3U1T3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Brms1lQ3U1T3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Brms1lQ3U1T3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Brms1lQ3U1T3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Brms1lQ3U1T3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Brms1lQ3U1T3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Brms1lQ3U1T3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Brms1lQ3U1T3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Brms1lQ3U1T3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Brms1lQ3U1T3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Brms1lQ3U1T3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brms1lQ3U1T3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brms1lQ3U1T3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brms1lQ3U1T3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brms1lQ3U1T3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brms1lQ3U1T3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brms1lQ3U1T3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brms1lQ3U1T3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brms1lQ3U1T3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brms1lQ3U1T3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brms1lQ3U1T3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brms1lQ3U1T3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brms1lQ3U1T3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brms1lQ3U1T3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Brms1lQ3U1T3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Brms1lQ3U1T3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Brms1lQ3U1T3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Brms1lQ3U1T3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Brms1lQ3U1T3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Brms1lQ3U1T3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Brms1lQ3U1T3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brms1lQ3U1T3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brms1lQ3U1T3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brms1lQ3U1T3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brms1lQ3U1T3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brms1lQ3U1T3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Brms1lQ3U1T3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Brms1lQ3U1T3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Brms1lQ3U1T3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brms1lQ3U1T3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brms1lQ3U1T3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Brms1lQ3U1T3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Brms1lQ3U1T3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brms1lQ3U1T3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brms1lQ3U1T3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brms1lQ3U1T3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brms1lQ3U1T3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brms1lQ3U1T3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Brms1lQ3U1T3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Brms1lQ3U1T3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Brms1lQ3U1T3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Brms1lQ3U1T3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Brms1lQ3U1T3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Brms1lQ3U1T3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brms1lQ3U1T3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brms1lQ3U1T3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brms1lQ3U1T3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brms1lQ3U1T3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms