Protein–RNA interactions for Protein: Q3TUD9

Tmem18, Transmembrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem18Q3TUD9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmem18Q3TUD9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmem18Q3TUD9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmem18Q3TUD9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmem18Q3TUD9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmem18Q3TUD9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmem18Q3TUD9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmem18Q3TUD9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmem18Q3TUD9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmem18Q3TUD9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmem18Q3TUD9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmem18Q3TUD9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmem18Q3TUD9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmem18Q3TUD9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmem18Q3TUD9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmem18Q3TUD9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmem18Q3TUD9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmem18Q3TUD9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmem18Q3TUD9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmem18Q3TUD9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmem18Q3TUD9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmem18Q3TUD9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmem18Q3TUD9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmem18Q3TUD9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tmem18Q3TUD9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tmem18Q3TUD9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tmem18Q3TUD9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tmem18Q3TUD9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tmem18Q3TUD9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tmem18Q3TUD9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tmem18Q3TUD9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tmem18Q3TUD9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmem18Q3TUD9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmem18Q3TUD9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmem18Q3TUD9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmem18Q3TUD9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmem18Q3TUD9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmem18Q3TUD9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmem18Q3TUD9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmem18Q3TUD9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmem18Q3TUD9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmem18Q3TUD9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmem18Q3TUD9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmem18Q3TUD9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmem18Q3TUD9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmem18Q3TUD9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmem18Q3TUD9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmem18Q3TUD9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmem18Q3TUD9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmem18Q3TUD9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmem18Q3TUD9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmem18Q3TUD9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmem18Q3TUD9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmem18Q3TUD9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmem18Q3TUD9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmem18Q3TUD9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmem18Q3TUD9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmem18Q3TUD9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmem18Q3TUD9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmem18Q3TUD9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmem18Q3TUD9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmem18Q3TUD9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmem18Q3TUD9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmem18Q3TUD9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmem18Q3TUD9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmem18Q3TUD9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmem18Q3TUD9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmem18Q3TUD9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmem18Q3TUD9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmem18Q3TUD9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmem18Q3TUD9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmem18Q3TUD9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmem18Q3TUD9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmem18Q3TUD9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmem18Q3TUD9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tmem18Q3TUD9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmem18Q3TUD9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmem18Q3TUD9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmem18Q3TUD9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmem18Q3TUD9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmem18Q3TUD9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmem18Q3TUD9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmem18Q3TUD9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmem18Q3TUD9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmem18Q3TUD9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmem18Q3TUD9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmem18Q3TUD9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmem18Q3TUD9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmem18Q3TUD9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmem18Q3TUD9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmem18Q3TUD9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmem18Q3TUD9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmem18Q3TUD9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmem18Q3TUD9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmem18Q3TUD9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmem18Q3TUD9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmem18Q3TUD9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmem18Q3TUD9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmem18Q3TUD9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmem18Q3TUD9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms