Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp39Q3TIX9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp39Q3TIX9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp39Q3TIX9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp39Q3TIX9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp39Q3TIX9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp39Q3TIX9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp39Q3TIX9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp39Q3TIX9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp39Q3TIX9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp39Q3TIX9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp39Q3TIX9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp39Q3TIX9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp39Q3TIX9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp39Q3TIX9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp39Q3TIX9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp39Q3TIX9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp39Q3TIX9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp39Q3TIX9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp39Q3TIX9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp39Q3TIX9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp39Q3TIX9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp39Q3TIX9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp39Q3TIX9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp39Q3TIX9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp39Q3TIX9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp39Q3TIX9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp39Q3TIX9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp39Q3TIX9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp39Q3TIX9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp39Q3TIX9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp39Q3TIX9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp39Q3TIX9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp39Q3TIX9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp39Q3TIX9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp39Q3TIX9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp39Q3TIX9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp39Q3TIX9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp39Q3TIX9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp39Q3TIX9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp39Q3TIX9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp39Q3TIX9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp39Q3TIX9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp39Q3TIX9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp39Q3TIX9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp39Q3TIX9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp39Q3TIX9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp39Q3TIX9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp39Q3TIX9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp39Q3TIX9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp39Q3TIX9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp39Q3TIX9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp39Q3TIX9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp39Q3TIX9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp39Q3TIX9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp39Q3TIX9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp39Q3TIX9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp39Q3TIX9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp39Q3TIX9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp39Q3TIX9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp39Q3TIX9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp39Q3TIX9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp39Q3TIX9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp39Q3TIX9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp39Q3TIX9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp39Q3TIX9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp39Q3TIX9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp39Q3TIX9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp39Q3TIX9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp39Q3TIX9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp39Q3TIX9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp39Q3TIX9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp39Q3TIX9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp39Q3TIX9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp39Q3TIX9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp39Q3TIX9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp39Q3TIX9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp39Q3TIX9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp39Q3TIX9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp39Q3TIX9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp39Q3TIX9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp39Q3TIX9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp39Q3TIX9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp39Q3TIX9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp39Q3TIX9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp39Q3TIX9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp39Q3TIX9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp39Q3TIX9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp39Q3TIX9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp39Q3TIX9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp39Q3TIX9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp39Q3TIX9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp39Q3TIX9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp39Q3TIX9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp39Q3TIX9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp39Q3TIX9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Usp39Q3TIX9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp39Q3TIX9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp39Q3TIX9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp39Q3TIX9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.8 ms