Protein–RNA interactions for Protein: Q3TA38

Tmem120b, Transmembrane protein 120B, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem120bQ3TA38 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmem120bQ3TA38 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmem120bQ3TA38 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmem120bQ3TA38 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmem120bQ3TA38 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmem120bQ3TA38 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmem120bQ3TA38 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmem120bQ3TA38 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmem120bQ3TA38 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmem120bQ3TA38 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmem120bQ3TA38 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmem120bQ3TA38 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmem120bQ3TA38 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmem120bQ3TA38 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmem120bQ3TA38 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmem120bQ3TA38 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmem120bQ3TA38 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmem120bQ3TA38 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmem120bQ3TA38 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmem120bQ3TA38 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmem120bQ3TA38 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmem120bQ3TA38 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmem120bQ3TA38 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmem120bQ3TA38 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmem120bQ3TA38 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmem120bQ3TA38 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmem120bQ3TA38 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmem120bQ3TA38 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmem120bQ3TA38 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmem120bQ3TA38 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmem120bQ3TA38 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmem120bQ3TA38 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmem120bQ3TA38 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmem120bQ3TA38 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmem120bQ3TA38 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmem120bQ3TA38 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmem120bQ3TA38 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmem120bQ3TA38 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmem120bQ3TA38 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmem120bQ3TA38 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmem120bQ3TA38 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmem120bQ3TA38 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmem120bQ3TA38 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmem120bQ3TA38 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmem120bQ3TA38 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmem120bQ3TA38 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmem120bQ3TA38 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmem120bQ3TA38 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmem120bQ3TA38 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmem120bQ3TA38 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmem120bQ3TA38 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tmem120bQ3TA38 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tmem120bQ3TA38 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tmem120bQ3TA38 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tmem120bQ3TA38 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tmem120bQ3TA38 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tmem120bQ3TA38 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tmem120bQ3TA38 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tmem120bQ3TA38 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tmem120bQ3TA38 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tmem120bQ3TA38 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tmem120bQ3TA38 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmem120bQ3TA38 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmem120bQ3TA38 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmem120bQ3TA38 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmem120bQ3TA38 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmem120bQ3TA38 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmem120bQ3TA38 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmem120bQ3TA38 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmem120bQ3TA38 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmem120bQ3TA38 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmem120bQ3TA38 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmem120bQ3TA38 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmem120bQ3TA38 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmem120bQ3TA38 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmem120bQ3TA38 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmem120bQ3TA38 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmem120bQ3TA38 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmem120bQ3TA38 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmem120bQ3TA38 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmem120bQ3TA38 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmem120bQ3TA38 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmem120bQ3TA38 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmem120bQ3TA38 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmem120bQ3TA38 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmem120bQ3TA38 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmem120bQ3TA38 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmem120bQ3TA38 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmem120bQ3TA38 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmem120bQ3TA38 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmem120bQ3TA38 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmem120bQ3TA38 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmem120bQ3TA38 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmem120bQ3TA38 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmem120bQ3TA38 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmem120bQ3TA38 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmem120bQ3TA38 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmem120bQ3TA38 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmem120bQ3TA38 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmem120bQ3TA38 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms