Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
Shroom4Q1W617 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.48■■■■□ 3.91
Shroom4Q1W617 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
Shroom4Q1W617 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC39.48■■■■□ 3.91
Shroom4Q1W617 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
Shroom4Q1W617 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.46■■■■□ 3.91
Shroom4Q1W617 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC39.45■■■■□ 3.91
Shroom4Q1W617 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC39.45■■■■□ 3.91
Shroom4Q1W617 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
Shroom4Q1W617 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.43■■■■□ 3.9
Shroom4Q1W617 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
Shroom4Q1W617 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
Shroom4Q1W617 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC39.41■■■■□ 3.9
Shroom4Q1W617 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
Shroom4Q1W617 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
Shroom4Q1W617 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
Shroom4Q1W617 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Shroom4Q1W617 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Shroom4Q1W617 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC39.38■■■■□ 3.9
Shroom4Q1W617 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
Shroom4Q1W617 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Shroom4Q1W617 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC39.35■■■■□ 3.89
Shroom4Q1W617 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Shroom4Q1W617 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
Shroom4Q1W617 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.89
Shroom4Q1W617 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Shroom4Q1W617 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
Shroom4Q1W617 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Shroom4Q1W617 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
Shroom4Q1W617 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
Shroom4Q1W617 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
Shroom4Q1W617 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.88
Shroom4Q1W617 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Shroom4Q1W617 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Shroom4Q1W617 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Shroom4Q1W617 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
Shroom4Q1W617 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Shroom4Q1W617 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Shroom4Q1W617 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC39.22■■■■□ 3.87
Shroom4Q1W617 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
Shroom4Q1W617 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
Shroom4Q1W617 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
Shroom4Q1W617 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
Shroom4Q1W617 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Shroom4Q1W617 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Shroom4Q1W617 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Shroom4Q1W617 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC39.15■■■■□ 3.86
Shroom4Q1W617 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC39.14■■■■□ 3.86
Shroom4Q1W617 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC39.13■■■■□ 3.85
Shroom4Q1W617 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
Shroom4Q1W617 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
Shroom4Q1W617 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
Shroom4Q1W617 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
Shroom4Q1W617 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Shroom4Q1W617 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Shroom4Q1W617 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Shroom4Q1W617 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Shroom4Q1W617 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Shroom4Q1W617 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Shroom4Q1W617 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Shroom4Q1W617 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
Shroom4Q1W617 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Shroom4Q1W617 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.84
Shroom4Q1W617 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Shroom4Q1W617 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
Shroom4Q1W617 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
Shroom4Q1W617 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC39.03■■■■□ 3.84
Shroom4Q1W617 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
Shroom4Q1W617 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.83
Shroom4Q1W617 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Shroom4Q1W617 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Shroom4Q1W617 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Shroom4Q1W617 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Shroom4Q1W617 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Shroom4Q1W617 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Shroom4Q1W617 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Shroom4Q1W617 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC38.97■■■■□ 3.83
Shroom4Q1W617 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Shroom4Q1W617 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Shroom4Q1W617 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Shroom4Q1W617 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Shroom4Q1W617 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Shroom4Q1W617 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Shroom4Q1W617 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Shroom4Q1W617 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Shroom4Q1W617 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Shroom4Q1W617 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Shroom4Q1W617 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
Shroom4Q1W617 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
Shroom4Q1W617 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Shroom4Q1W617 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Shroom4Q1W617 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Shroom4Q1W617 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC38.89■■■■□ 3.82
Shroom4Q1W617 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Shroom4Q1W617 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
Shroom4Q1W617 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC38.88■■■■□ 3.81
Shroom4Q1W617 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC38.88■■■■□ 3.81
Shroom4Q1W617 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Shroom4Q1W617 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC38.83■■■■□ 3.81
Shroom4Q1W617 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
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