Protein–RNA interactions for Protein: Q12110

YLR049C, Uncharacterized protein YLR049C, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR049CQ12110 PAR32YDL173W 888 nt8.12□□□□□ -1.11
YLR049CQ12110 IGD1YFR017C 588 nt8.12□□□□□ -1.11
YLR049CQ12110 YKR012CYKR012C 378 nt8.12□□□□□ -1.11
YLR049CQ12110 PAU19YMR325W 375 nt8.12□□□□□ -1.11
YLR049CQ12110 PTC6YCR079W 1329 nt8.11□□□□□ -1.11
YLR049CQ12110 YMC2YBR104W 990 nt8.11□□□□□ -1.11
YLR049CQ12110 MTO1YGL236C 2010 nt8.1□□□□□ -1.11
YLR049CQ12110 PHB2YGR231C 933 nt8.09□□□□□ -1.11
YLR049CQ12110 YPT11YNL304W 1254 nt8.09□□□□□ -1.11
YLR049CQ12110 SDS24YBR214W 1584 nt8.09□□□□□ -1.11
YLR049CQ12110 AAT1YKL106W 1356 nt8.09□□□□□ -1.12
YLR049CQ12110 ADH3YMR083W 1128 nt8.08□□□□□ -1.12
YLR049CQ12110 VBA3YCL069W 1377 nt8.07□□□□□ -1.12
YLR049CQ12110 SLG1YOR008C 1137 nt8.06□□□□□ -1.12
YLR049CQ12110 TRP2YER090W 1524 nt8.06□□□□□ -1.12
YLR049CQ12110 MRS4YKR052C 915 nt8.05□□□□□ -1.12
YLR049CQ12110 AAC3YBR085W 924 nt8.05□□□□□ -1.12
YLR049CQ12110 THI6YPL214C 1623 nt8.04□□□□□ -1.12
YLR049CQ12110 MOB1YIL106W 945 nt8.03□□□□□ -1.12
YLR049CQ12110 MET8YBR213W 825 nt8.03□□□□□ -1.12
YLR049CQ12110 HXT11YOL156W 1704 nt8.03□□□□□ -1.12
YLR049CQ12110 EMC3YKL207W 762 nt8.02□□□□□ -1.13
YLR049CQ12110 TPN1YGL186C 1740 nt8.02□□□□□ -1.13
YLR049CQ12110 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt8.01□□□□□ -1.13
YLR049CQ12110 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt8.01□□□□□ -1.13
YLR049CQ12110 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt8.01□□□□□ -1.13
YLR049CQ12110 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt8.01□□□□□ -1.13
YLR049CQ12110 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt8.01□□□□□ -1.13
YLR049CQ12110 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt8.01□□□□□ -1.13
YLR049CQ12110 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt8.01□□□□□ -1.13
YLR049CQ12110 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt8.01□□□□□ -1.13
YLR049CQ12110 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt8.01□□□□□ -1.13
YLR049CQ12110 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt8.01□□□□□ -1.13
YLR049CQ12110 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt8.01□□□□□ -1.13
YLR049CQ12110 TMS1YDR105C 1422 nt8.01□□□□□ -1.13
YLR049CQ12110 YLR072WYLR072W 2082 nt8.01□□□□□ -1.13
YLR049CQ12110 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt8□□□□□ -1.13
YLR049CQ12110 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt8□□□□□ -1.13
YLR049CQ12110 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt8□□□□□ -1.13
YLR049CQ12110 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt8□□□□□ -1.13
YLR049CQ12110 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt8□□□□□ -1.13
YLR049CQ12110 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt8□□□□□ -1.13
YLR049CQ12110 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt8□□□□□ -1.13
YLR049CQ12110 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt8□□□□□ -1.13
YLR049CQ12110 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt8□□□□□ -1.13
YLR049CQ12110 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt8□□□□□ -1.13
YLR049CQ12110 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt8□□□□□ -1.13
YLR049CQ12110 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt8□□□□□ -1.13
YLR049CQ12110 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt8□□□□□ -1.13
YLR049CQ12110 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt8□□□□□ -1.13
YLR049CQ12110 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt8□□□□□ -1.13
YLR049CQ12110 FLX1YIL134W 936 nt8□□□□□ -1.13
YLR049CQ12110 ENO1YGR254W 1314 nt8□□□□□ -1.13
YLR049CQ12110 HMG2YLR450W 3138 nt7.99□□□□□ -1.13
YLR049CQ12110 LYS20YDL182W 1287 nt7.99□□□□□ -1.13
YLR049CQ12110 RSM7YJR113C 744 nt7.99□□□□□ -1.13
YLR049CQ12110 RIB1YBL033C 1038 nt7.99□□□□□ -1.13
YLR049CQ12110 IPL1YPL209C 1104 nt7.99□□□□□ -1.13
YLR049CQ12110 snR86snR86 1004 nt7.98□□□□□ -1.13
YLR049CQ12110 YFR020WYFR020W 699 nt7.98□□□□□ -1.13
YLR049CQ12110 YOR072WYOR072W 315 nt7.97□□□□□ -1.13
YLR049CQ12110 ALD5YER073W 1563 nt7.97□□□□□ -1.13
YLR049CQ12110 SRM1YGL097W 1449 nt7.95□□□□□ -1.14
YLR049CQ12110 HXK1YFR053C 1458 nt7.95□□□□□ -1.14
YLR049CQ12110 ERG6YML008C 1152 nt7.94□□□□□ -1.14
YLR049CQ12110 MIM1YOL026C 342 nt7.94□□□□□ -1.14
YLR049CQ12110 YJL009WYJL009W 327 nt7.93□□□□□ -1.14
YLR049CQ12110 CYC3YAL039C 810 nt7.93□□□□□ -1.14
YLR049CQ12110 HBS1YKR084C 1836 nt7.93□□□□□ -1.14
YLR049CQ12110 YBR056WYBR056W 1506 nt7.93□□□□□ -1.14
YLR049CQ12110 NPP1YCR026C 2229 nt7.93□□□□□ -1.14
YLR049CQ12110 YIA6YIL006W 1122 nt7.92□□□□□ -1.14
YLR049CQ12110 YIR035CYIR035C 765 nt7.92□□□□□ -1.14
YLR049CQ12110 YJR149WYJR149W 1215 nt7.92□□□□□ -1.14
YLR049CQ12110 YMR210WYMR210W 1350 nt7.92□□□□□ -1.14
YLR049CQ12110 SRP102YKL154W 735 nt7.91□□□□□ -1.14
YLR049CQ12110 YLR280CYLR280C 351 nt7.91□□□□□ -1.14
YLR049CQ12110 SOD2YHR008C 702 nt7.9□□□□□ -1.14
YLR049CQ12110 YCR025CYCR025C 411 nt7.89□□□□□ -1.15
YLR049CQ12110 BUB2YMR055C 921 nt7.89□□□□□ -1.15
YLR049CQ12110 LEA1YPL213W 717 nt7.89□□□□□ -1.15
YLR049CQ12110 MEX67YPL169C 1800 nt7.89□□□□□ -1.15
YLR049CQ12110 ABP1YCR088W 1779 nt7.89□□□□□ -1.15
YLR049CQ12110 MEP1YGR121C 1479 nt7.88□□□□□ -1.15
YLR049CQ12110 YJR154WYJR154W 1041 nt7.88□□□□□ -1.15
YLR049CQ12110 ORT1YOR130C 879 nt7.88□□□□□ -1.15
YLR049CQ12110 DUR3YHL016C 2208 nt7.88□□□□□ -1.15
YLR049CQ12110 FTH1YBR207W 1398 nt7.87□□□□□ -1.15
YLR049CQ12110 ERO1YML130C 1692 nt7.87□□□□□ -1.15
YLR049CQ12110 GID7YCL039W 2238 nt7.86□□□□□ -1.15
YLR049CQ12110 YLR460CYLR460C 1131 nt7.86□□□□□ -1.15
YLR049CQ12110 HIS3YOR202W 663 nt7.86□□□□□ -1.15
YLR049CQ12110 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.86□□□□□ -1.15
YLR049CQ12110 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.86□□□□□ -1.15
YLR049CQ12110 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.86□□□□□ -1.15
YLR049CQ12110 SER2YGR208W 930 nt7.85□□□□□ -1.15
YLR049CQ12110 RNA170RNA170 169 nt7.84□□□□□ -1.15
YLR049CQ12110 Q0010Q0010 387 nt7.84□□□□□ -1.15
YLR049CQ12110 BSP1YPR171W 1731 nt7.83□□□□□ -1.16
YLR049CQ12110 CHS7YHR142W 951 nt7.83□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 30.1 ms