Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBN2

Dsel, Dermatan-sulfate epimerase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DselQ0VBN2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DselQ0VBN2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DselQ0VBN2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DselQ0VBN2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DselQ0VBN2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DselQ0VBN2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DselQ0VBN2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DselQ0VBN2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
DselQ0VBN2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
DselQ0VBN2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DselQ0VBN2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DselQ0VBN2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DselQ0VBN2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DselQ0VBN2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DselQ0VBN2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DselQ0VBN2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
DselQ0VBN2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
DselQ0VBN2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DselQ0VBN2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DselQ0VBN2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DselQ0VBN2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DselQ0VBN2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DselQ0VBN2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DselQ0VBN2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DselQ0VBN2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DselQ0VBN2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DselQ0VBN2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DselQ0VBN2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DselQ0VBN2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DselQ0VBN2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DselQ0VBN2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DselQ0VBN2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DselQ0VBN2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DselQ0VBN2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DselQ0VBN2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DselQ0VBN2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DselQ0VBN2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DselQ0VBN2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DselQ0VBN2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DselQ0VBN2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DselQ0VBN2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DselQ0VBN2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DselQ0VBN2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DselQ0VBN2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DselQ0VBN2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DselQ0VBN2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DselQ0VBN2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DselQ0VBN2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DselQ0VBN2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DselQ0VBN2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DselQ0VBN2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DselQ0VBN2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DselQ0VBN2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DselQ0VBN2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DselQ0VBN2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
DselQ0VBN2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DselQ0VBN2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
DselQ0VBN2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DselQ0VBN2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DselQ0VBN2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DselQ0VBN2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DselQ0VBN2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DselQ0VBN2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DselQ0VBN2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DselQ0VBN2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DselQ0VBN2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DselQ0VBN2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DselQ0VBN2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DselQ0VBN2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DselQ0VBN2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DselQ0VBN2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DselQ0VBN2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DselQ0VBN2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DselQ0VBN2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DselQ0VBN2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DselQ0VBN2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DselQ0VBN2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DselQ0VBN2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DselQ0VBN2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DselQ0VBN2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DselQ0VBN2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DselQ0VBN2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DselQ0VBN2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DselQ0VBN2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DselQ0VBN2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DselQ0VBN2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DselQ0VBN2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DselQ0VBN2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DselQ0VBN2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DselQ0VBN2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DselQ0VBN2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DselQ0VBN2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
DselQ0VBN2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
DselQ0VBN2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DselQ0VBN2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DselQ0VBN2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DselQ0VBN2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DselQ0VBN2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DselQ0VBN2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DselQ0VBN2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms