Protein–RNA interactions for Protein: Q09143

Slc7a1, High affinity cationic amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a1Q09143 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Slc7a1Q09143 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Slc7a1Q09143 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slc7a1Q09143 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Slc7a1Q09143 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Slc7a1Q09143 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Slc7a1Q09143 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Slc7a1Q09143 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Slc7a1Q09143 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Slc7a1Q09143 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Slc7a1Q09143 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Slc7a1Q09143 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slc7a1Q09143 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slc7a1Q09143 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slc7a1Q09143 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slc7a1Q09143 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slc7a1Q09143 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slc7a1Q09143 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slc7a1Q09143 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slc7a1Q09143 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slc7a1Q09143 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Slc7a1Q09143 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slc7a1Q09143 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Slc7a1Q09143 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Slc7a1Q09143 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Slc7a1Q09143 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Slc7a1Q09143 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Slc7a1Q09143 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Slc7a1Q09143 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slc7a1Q09143 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slc7a1Q09143 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slc7a1Q09143 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slc7a1Q09143 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slc7a1Q09143 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Slc7a1Q09143 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Slc7a1Q09143 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slc7a1Q09143 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slc7a1Q09143 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slc7a1Q09143 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slc7a1Q09143 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Slc7a1Q09143 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Slc7a1Q09143 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Slc7a1Q09143 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Slc7a1Q09143 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Slc7a1Q09143 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Slc7a1Q09143 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Slc7a1Q09143 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Slc7a1Q09143 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Slc7a1Q09143 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Slc7a1Q09143 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Slc7a1Q09143 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Slc7a1Q09143 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Slc7a1Q09143 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Slc7a1Q09143 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Slc7a1Q09143 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Slc7a1Q09143 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Slc7a1Q09143 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Slc7a1Q09143 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
Slc7a1Q09143 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Slc7a1Q09143 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Slc7a1Q09143 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Slc7a1Q09143 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Slc7a1Q09143 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Slc7a1Q09143 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Slc7a1Q09143 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Slc7a1Q09143 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Slc7a1Q09143 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Slc7a1Q09143 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Slc7a1Q09143 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Slc7a1Q09143 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Slc7a1Q09143 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Slc7a1Q09143 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Slc7a1Q09143 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Slc7a1Q09143 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Slc7a1Q09143 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Slc7a1Q09143 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Slc7a1Q09143 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Slc7a1Q09143 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Slc7a1Q09143 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Slc7a1Q09143 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Slc7a1Q09143 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Slc7a1Q09143 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Slc7a1Q09143 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Slc7a1Q09143 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Slc7a1Q09143 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Slc7a1Q09143 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Slc7a1Q09143 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Slc7a1Q09143 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Slc7a1Q09143 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Slc7a1Q09143 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Slc7a1Q09143 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Slc7a1Q09143 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Slc7a1Q09143 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Slc7a1Q09143 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Slc7a1Q09143 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Slc7a1Q09143 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Slc7a1Q09143 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Slc7a1Q09143 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Slc7a1Q09143 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Slc7a1Q09143 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 158.5 ms