Protein–RNA interactions for Protein: Q08687

TMA16, Translation machinery-associated protein 16, yeastyeast

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TMA16Q08687 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt9.15□□□□□ -0.94
TMA16Q08687 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt9.15□□□□□ -0.94
TMA16Q08687 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt9.15□□□□□ -0.94
TMA16Q08687 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt9.15□□□□□ -0.94
TMA16Q08687 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt9.15□□□□□ -0.94
TMA16Q08687 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt9.15□□□□□ -0.94
TMA16Q08687 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt9.15□□□□□ -0.94
TMA16Q08687 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt9.15□□□□□ -0.94
TMA16Q08687 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt9.15□□□□□ -0.94
TMA16Q08687 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt9.15□□□□□ -0.94
TMA16Q08687 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt9.15□□□□□ -0.94
TMA16Q08687 GAS1YMR307W 1680 nt9.15□□□□□ -0.94
TMA16Q08687 YLR072WYLR072W 2082 nt9.15□□□□□ -0.94
TMA16Q08687 PAU5YFL020C 369 nt9.14□□□□□ -0.95
TMA16Q08687 KRE1YNL322C 942 nt9.14□□□□□ -0.95
TMA16Q08687 SRM1YGL097W 1449 nt9.14□□□□□ -0.95
TMA16Q08687 PAU15YIR041W 375 nt9.13□□□□□ -0.95
TMA16Q08687 PGC1YPL206C 966 nt9.13□□□□□ -0.95
TMA16Q08687 HXK1YFR053C 1458 nt9.13□□□□□ -0.95
TMA16Q08687 EMC3YKL207W 762 nt9.12□□□□□ -0.95
TMA16Q08687 NME1NME1 340 nt9.12□□□□□ -0.95
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TMA16Q08687 PHB2YGR231C 933 nt9.1□□□□□ -0.95
TMA16Q08687 MRS4YKR052C 915 nt9.09□□□□□ -0.95
TMA16Q08687 ADH3YMR083W 1128 nt9.09□□□□□ -0.95
TMA16Q08687 AAC3YBR085W 924 nt9.09□□□□□ -0.95
TMA16Q08687 SDS24YBR214W 1584 nt9.08□□□□□ -0.96
TMA16Q08687 FSH2YMR222C 672 nt9.08□□□□□ -0.96
TMA16Q08687 VBA3YCL069W 1377 nt9.08□□□□□ -0.96
TMA16Q08687 snR86snR86 1004 nt9.07□□□□□ -0.96
TMA16Q08687 IGD1YFR017C 588 nt9.07□□□□□ -0.96
TMA16Q08687 YOR072WYOR072W 315 nt9.07□□□□□ -0.96
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TMA16Q08687 MIM1YOL026C 342 nt9.06□□□□□ -0.96
TMA16Q08687 HBS1YKR084C 1836 nt9.05□□□□□ -0.96
TMA16Q08687 MEX67YPL169C 1800 nt9.05□□□□□ -0.96
TMA16Q08687 FTH1YBR207W 1398 nt9.04□□□□□ -0.96
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TMA16Q08687 YPT11YNL304W 1254 nt9.03□□□□□ -0.96
TMA16Q08687 ABP1YCR088W 1779 nt9.01□□□□□ -0.97
TMA16Q08687 TMS1YDR105C 1422 nt9.01□□□□□ -0.97
TMA16Q08687 STP3YLR375W 1032 nt9.01□□□□□ -0.97
TMA16Q08687 YBR232CYBR232C 360 nt8.99□□□□□ -0.97
TMA16Q08687 MEP1YGR121C 1479 nt8.99□□□□□ -0.97
TMA16Q08687 YMR210WYMR210W 1350 nt8.99□□□□□ -0.97
TMA16Q08687 PAR32YDL173W 888 nt8.98□□□□□ -0.97
TMA16Q08687 LEA1YPL213W 717 nt8.98□□□□□ -0.97
TMA16Q08687 YBR056WYBR056W 1506 nt8.97□□□□□ -0.97
TMA16Q08687 MOB1YIL106W 945 nt8.97□□□□□ -0.97
TMA16Q08687 ORT1YOR130C 879 nt8.97□□□□□ -0.97
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TMA16Q08687 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt8.96□□□□□ -0.98
TMA16Q08687 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt8.96□□□□□ -0.98
TMA16Q08687 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt8.96□□□□□ -0.98
TMA16Q08687 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt8.96□□□□□ -0.98
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TMA16Q08687 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt8.96□□□□□ -0.98
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TMA16Q08687 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt8.96□□□□□ -0.98
TMA16Q08687 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt8.96□□□□□ -0.98
TMA16Q08687 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt8.96□□□□□ -0.98
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TMA16Q08687 YJL009WYJL009W 327 nt8.94□□□□□ -0.98
TMA16Q08687 snR4snR4 186 nt8.94□□□□□ -0.98
TMA16Q08687 MDL2YPL270W 2322 nt8.93□□□□□ -0.98
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TMA16Q08687 LYS20YDL182W 1287 nt8.92□□□□□ -0.98
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TMA16Q08687 IPL1YPL209C 1104 nt8.9□□□□□ -0.98
TMA16Q08687 DUS3YLR401C 2007 nt8.9□□□□□ -0.99
TMA16Q08687 BUB2YMR055C 921 nt8.89□□□□□ -0.99
TMA16Q08687 RNA170RNA170 169 nt8.88□□□□□ -0.99
TMA16Q08687 YLR280CYLR280C 351 nt8.85□□□□□ -0.99
TMA16Q08687 YIR035CYIR035C 765 nt8.84□□□□□ -0.99
TMA16Q08687 INO1YJL153C 1602 nt8.82□□□□□ -1
TMA16Q08687 LRO1YNR008W 1986 nt8.82□□□□□ -1
TMA16Q08687 MRN1YPL184C 1839 nt8.82□□□□□ -1
TMA16Q08687 CYC3YAL039C 810 nt8.81□□□□□ -1
TMA16Q08687 MET22YOL064C 1074 nt8.81□□□□□ -1
TMA16Q08687 ERO1YML130C 1692 nt8.81□□□□□ -1
TMA16Q08687 DIP5YPL265W 1827 nt8.8□□□□□ -1
TMA16Q08687 YJL064WYJL064W 396 nt8.8□□□□□ -1
TMA16Q08687 SRP102YKL154W 735 nt8.8□□□□□ -1
TMA16Q08687 EHT1YBR177C 1356 nt8.79□□□□□ -1
TMA16Q08687 BUD31YCR063W 474 nt8.79□□□□□ -1
TMA16Q08687 GTB1YDR221W 2109 nt8.78□□□□□ -1
TMA16Q08687 DIA4YHR011W 1341 nt8.78□□□□□ -1
TMA16Q08687 POP2YNR052C 1302 nt8.78□□□□□ -1
TMA16Q08687 SEN2YLR105C 1134 nt8.77□□□□□ -1.01
TMA16Q08687 GID7YCL039W 2238 nt8.76□□□□□ -1.01
TMA16Q08687 YCR025CYCR025C 411 nt8.76□□□□□ -1.01
TMA16Q08687 SHC1YER096W 1539 nt8.75□□□□□ -1.01
TMA16Q08687 TGA1tA(UGC)A 73 nt8.75□□□□□ -1.01
TMA16Q08687 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt8.75□□□□□ -1.01
TMA16Q08687 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt8.75□□□□□ -1.01
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