Protein–RNA interactions for Protein: Q08024

Cbfb, Core-binding factor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbfbQ08024 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CbfbQ08024 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CbfbQ08024 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CbfbQ08024 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CbfbQ08024 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CbfbQ08024 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CbfbQ08024 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CbfbQ08024 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CbfbQ08024 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CbfbQ08024 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CbfbQ08024 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CbfbQ08024 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CbfbQ08024 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CbfbQ08024 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CbfbQ08024 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CbfbQ08024 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CbfbQ08024 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CbfbQ08024 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CbfbQ08024 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CbfbQ08024 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CbfbQ08024 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CbfbQ08024 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CbfbQ08024 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CbfbQ08024 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CbfbQ08024 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CbfbQ08024 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CbfbQ08024 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CbfbQ08024 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CbfbQ08024 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CbfbQ08024 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CbfbQ08024 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CbfbQ08024 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CbfbQ08024 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CbfbQ08024 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CbfbQ08024 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CbfbQ08024 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CbfbQ08024 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CbfbQ08024 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CbfbQ08024 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CbfbQ08024 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CbfbQ08024 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CbfbQ08024 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CbfbQ08024 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CbfbQ08024 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CbfbQ08024 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CbfbQ08024 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CbfbQ08024 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CbfbQ08024 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CbfbQ08024 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CbfbQ08024 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CbfbQ08024 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CbfbQ08024 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CbfbQ08024 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CbfbQ08024 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CbfbQ08024 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CbfbQ08024 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CbfbQ08024 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CbfbQ08024 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CbfbQ08024 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CbfbQ08024 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CbfbQ08024 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CbfbQ08024 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CbfbQ08024 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CbfbQ08024 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CbfbQ08024 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CbfbQ08024 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CbfbQ08024 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CbfbQ08024 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CbfbQ08024 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CbfbQ08024 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CbfbQ08024 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CbfbQ08024 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CbfbQ08024 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CbfbQ08024 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CbfbQ08024 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CbfbQ08024 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CbfbQ08024 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CbfbQ08024 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CbfbQ08024 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CbfbQ08024 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CbfbQ08024 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CbfbQ08024 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CbfbQ08024 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CbfbQ08024 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CbfbQ08024 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CbfbQ08024 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CbfbQ08024 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CbfbQ08024 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CbfbQ08024 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CbfbQ08024 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CbfbQ08024 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CbfbQ08024 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CbfbQ08024 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CbfbQ08024 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CbfbQ08024 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CbfbQ08024 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CbfbQ08024 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CbfbQ08024 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CbfbQ08024 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CbfbQ08024 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms