Protein–RNA interactions for Protein: Q05549

HRQ1, ATP-dependent helicase HRQ1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRQ1Q05549 ESS1YJR017C 513 nt9.61□□□□□ -0.87
HRQ1Q05549 STE4YOR212W 1272 nt9.61□□□□□ -0.87
HRQ1Q05549 NAS2YIL007C 663 nt9.6□□□□□ -0.87
HRQ1Q05549 RAD51YER095W 1203 nt9.59□□□□□ -0.87
HRQ1Q05549 EMC3YKL207W 762 nt9.59□□□□□ -0.87
HRQ1Q05549 HXT11YOL156W 1704 nt9.59□□□□□ -0.87
HRQ1Q05549 YLR349WYLR349W 507 nt9.58□□□□□ -0.88
HRQ1Q05549 SRM1YGL097W 1449 nt9.56□□□□□ -0.88
HRQ1Q05549 MEX67YPL169C 1800 nt9.56□□□□□ -0.88
HRQ1Q05549 TUB4YLR212C 1422 nt9.56□□□□□ -0.88
HRQ1Q05549 PTC6YCR079W 1329 nt9.56□□□□□ -0.88
HRQ1Q05549 GAS1YMR307W 1680 nt9.55□□□□□ -0.88
HRQ1Q05549 REX2YLR059C 810 nt9.55□□□□□ -0.88
HRQ1Q05549 MIM1YOL026C 342 nt9.55□□□□□ -0.88
HRQ1Q05549 PAU21YOR394W 495 nt9.55□□□□□ -0.88
HRQ1Q05549 PAU22YPL282C 495 nt9.55□□□□□ -0.88
HRQ1Q05549 CPD1YGR247W 720 nt9.54□□□□□ -0.88
HRQ1Q05549 KRE1YNL322C 942 nt9.54□□□□□ -0.88
HRQ1Q05549 CDD1YLR245C 429 nt9.53□□□□□ -0.88
HRQ1Q05549 MRS4YKR052C 915 nt9.52□□□□□ -0.89
HRQ1Q05549 GSF2YML048W 1212 nt9.51□□□□□ -0.89
HRQ1Q05549 YLR072WYLR072W 2082 nt9.51□□□□□ -0.89
HRQ1Q05549 TPN1YGL186C 1740 nt9.49□□□□□ -0.89
HRQ1Q05549 YKR012CYKR012C 378 nt9.49□□□□□ -0.89
HRQ1Q05549 HBS1YKR084C 1836 nt9.49□□□□□ -0.89
HRQ1Q05549 THP3YPR045C 1413 nt9.48□□□□□ -0.89
HRQ1Q05549 AAC3YBR085W 924 nt9.48□□□□□ -0.89
HRQ1Q05549 FTH1YBR207W 1398 nt9.48□□□□□ -0.89
HRQ1Q05549 snR86snR86 1004 nt9.47□□□□□ -0.89
HRQ1Q05549 DUR3YHL016C 2208 nt9.47□□□□□ -0.89
HRQ1Q05549 FRE6YLL051C 2139 nt9.46□□□□□ -0.89
HRQ1Q05549 Q0010Q0010 387 nt9.45□□□□□ -0.9
HRQ1Q05549 ADH7YCR105W 1086 nt9.44□□□□□ -0.9
HRQ1Q05549 PAU5YFL020C 369 nt9.44□□□□□ -0.9
HRQ1Q05549 ARO7YPR060C 771 nt9.44□□□□□ -0.9
HRQ1Q05549 SDS24YBR214W 1584 nt9.42□□□□□ -0.9
HRQ1Q05549 VBA3YCL069W 1377 nt9.42□□□□□ -0.9
HRQ1Q05549 YMR210WYMR210W 1350 nt9.42□□□□□ -0.9
HRQ1Q05549 PHB2YGR231C 933 nt9.42□□□□□ -0.9
HRQ1Q05549 PAU15YIR041W 375 nt9.42□□□□□ -0.9
HRQ1Q05549 YJR154WYJR154W 1041 nt9.42□□□□□ -0.9
HRQ1Q05549 ADH3YMR083W 1128 nt9.42□□□□□ -0.9
HRQ1Q05549 ORT1YOR130C 879 nt9.42□□□□□ -0.9
HRQ1Q05549 YPT11YNL304W 1254 nt9.41□□□□□ -0.9
HRQ1Q05549 ABP1YCR088W 1779 nt9.41□□□□□ -0.9
HRQ1Q05549 MEP1YGR121C 1479 nt9.4□□□□□ -0.9
HRQ1Q05549 FSH2YMR222C 672 nt9.4□□□□□ -0.9
HRQ1Q05549 LEA1YPL213W 717 nt9.4□□□□□ -0.9
HRQ1Q05549 snR4snR4 186 nt9.4□□□□□ -0.9
HRQ1Q05549 TMS1YDR105C 1422 nt9.39□□□□□ -0.91
HRQ1Q05549 PGC1YPL206C 966 nt9.38□□□□□ -0.91
HRQ1Q05549 IGD1YFR017C 588 nt9.37□□□□□ -0.91
HRQ1Q05549 YJL009WYJL009W 327 nt9.37□□□□□ -0.91
HRQ1Q05549 YJR149WYJR149W 1215 nt9.37□□□□□ -0.91
HRQ1Q05549 NPP1YCR026C 2229 nt9.36□□□□□ -0.91
HRQ1Q05549 MDL2YPL270W 2322 nt9.36□□□□□ -0.91
HRQ1Q05549 URA8YJR103W 1737 nt9.34□□□□□ -0.91
HRQ1Q05549 MOB1YIL106W 945 nt9.34□□□□□ -0.91
HRQ1Q05549 YBR056WYBR056W 1506 nt9.34□□□□□ -0.91
HRQ1Q05549 DUS3YLR401C 2007 nt9.33□□□□□ -0.92
HRQ1Q05549 LYS20YDL182W 1287 nt9.33□□□□□ -0.92
HRQ1Q05549 HIS3YOR202W 663 nt9.32□□□□□ -0.92
HRQ1Q05549 YRF1-2YER190W 5046 nt9.31□□□□□ -0.92
HRQ1Q05549 PAR32YDL173W 888 nt9.3□□□□□ -0.92
HRQ1Q05549 YFR020WYFR020W 699 nt9.3□□□□□ -0.92
HRQ1Q05549 RSM7YJR113C 744 nt9.29□□□□□ -0.92
HRQ1Q05549 STP3YLR375W 1032 nt9.29□□□□□ -0.92
HRQ1Q05549 ENO1YGR254W 1314 nt9.28□□□□□ -0.92
HRQ1Q05549 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt9.27□□□□□ -0.93
HRQ1Q05549 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt9.27□□□□□ -0.93
HRQ1Q05549 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt9.27□□□□□ -0.93
HRQ1Q05549 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt9.27□□□□□ -0.93
HRQ1Q05549 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt9.27□□□□□ -0.93
HRQ1Q05549 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt9.27□□□□□ -0.93
HRQ1Q05549 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt9.27□□□□□ -0.93
HRQ1Q05549 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt9.27□□□□□ -0.93
HRQ1Q05549 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt9.27□□□□□ -0.93
HRQ1Q05549 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt9.27□□□□□ -0.93
HRQ1Q05549 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt9.27□□□□□ -0.93
HRQ1Q05549 BUB2YMR055C 921 nt9.27□□□□□ -0.93
HRQ1Q05549 INO1YJL153C 1602 nt9.25□□□□□ -0.93
HRQ1Q05549 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt9.25□□□□□ -0.93
HRQ1Q05549 FLX1YIL134W 936 nt9.25□□□□□ -0.93
HRQ1Q05549 YIR035CYIR035C 765 nt9.23□□□□□ -0.93
HRQ1Q05549 YBR232CYBR232C 360 nt9.23□□□□□ -0.93
HRQ1Q05549 POP2YNR052C 1302 nt9.22□□□□□ -0.93
HRQ1Q05549 MRN1YPL184C 1839 nt9.21□□□□□ -0.93
HRQ1Q05549 FIT1YDR534C 1587 nt9.21□□□□□ -0.93
HRQ1Q05549 RNA170RNA170 169 nt9.21□□□□□ -0.94
HRQ1Q05549 IPL1YPL209C 1104 nt9.21□□□□□ -0.94
HRQ1Q05549 YLR280CYLR280C 351 nt9.2□□□□□ -0.94
HRQ1Q05549 ADE16YLR028C 1776 nt9.19□□□□□ -0.94
HRQ1Q05549 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt9.19□□□□□ -0.94
HRQ1Q05549 DIA4YHR011W 1341 nt9.19□□□□□ -0.94
HRQ1Q05549 LRO1YNR008W 1986 nt9.17□□□□□ -0.94
HRQ1Q05549 BUD31YCR063W 474 nt9.17□□□□□ -0.94
HRQ1Q05549 UFD1YGR048W 1086 nt9.17□□□□□ -0.94
HRQ1Q05549 MET22YOL064C 1074 nt9.17□□□□□ -0.94
HRQ1Q05549 NDE2YDL085W 1638 nt9.16□□□□□ -0.94
HRQ1Q05549 DIP5YPL265W 1827 nt9.16□□□□□ -0.94
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