Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rcn1Q05186 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rcn1Q05186 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rcn1Q05186 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rcn1Q05186 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rcn1Q05186 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rcn1Q05186 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rcn1Q05186 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rcn1Q05186 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rcn1Q05186 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rcn1Q05186 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rcn1Q05186 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rcn1Q05186 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rcn1Q05186 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rcn1Q05186 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rcn1Q05186 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rcn1Q05186 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rcn1Q05186 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Rcn1Q05186 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rcn1Q05186 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rcn1Q05186 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rcn1Q05186 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rcn1Q05186 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rcn1Q05186 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rcn1Q05186 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rcn1Q05186 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rcn1Q05186 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rcn1Q05186 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rcn1Q05186 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rcn1Q05186 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rcn1Q05186 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rcn1Q05186 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rcn1Q05186 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rcn1Q05186 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rcn1Q05186 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rcn1Q05186 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rcn1Q05186 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rcn1Q05186 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rcn1Q05186 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rcn1Q05186 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rcn1Q05186 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rcn1Q05186 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rcn1Q05186 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rcn1Q05186 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rcn1Q05186 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rcn1Q05186 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rcn1Q05186 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rcn1Q05186 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rcn1Q05186 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rcn1Q05186 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rcn1Q05186 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rcn1Q05186 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rcn1Q05186 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rcn1Q05186 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rcn1Q05186 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rcn1Q05186 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rcn1Q05186 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rcn1Q05186 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rcn1Q05186 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rcn1Q05186 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rcn1Q05186 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rcn1Q05186 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rcn1Q05186 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rcn1Q05186 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rcn1Q05186 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rcn1Q05186 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rcn1Q05186 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rcn1Q05186 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rcn1Q05186 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rcn1Q05186 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rcn1Q05186 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rcn1Q05186 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rcn1Q05186 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rcn1Q05186 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rcn1Q05186 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rcn1Q05186 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rcn1Q05186 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rcn1Q05186 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rcn1Q05186 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rcn1Q05186 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rcn1Q05186 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rcn1Q05186 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rcn1Q05186 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rcn1Q05186 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rcn1Q05186 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rcn1Q05186 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rcn1Q05186 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rcn1Q05186 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rcn1Q05186 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rcn1Q05186 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rcn1Q05186 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rcn1Q05186 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rcn1Q05186 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rcn1Q05186 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rcn1Q05186 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rcn1Q05186 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rcn1Q05186 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rcn1Q05186 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rcn1Q05186 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rcn1Q05186 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms