Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Thbs2Q03350 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Thbs2Q03350 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Thbs2Q03350 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Thbs2Q03350 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Thbs2Q03350 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Thbs2Q03350 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Thbs2Q03350 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Thbs2Q03350 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Thbs2Q03350 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Thbs2Q03350 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Thbs2Q03350 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Thbs2Q03350 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Thbs2Q03350 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Thbs2Q03350 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Thbs2Q03350 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Thbs2Q03350 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Thbs2Q03350 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Thbs2Q03350 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Thbs2Q03350 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Thbs2Q03350 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Thbs2Q03350 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Thbs2Q03350 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Thbs2Q03350 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Thbs2Q03350 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Thbs2Q03350 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Thbs2Q03350 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Thbs2Q03350 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Thbs2Q03350 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Thbs2Q03350 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Thbs2Q03350 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Thbs2Q03350 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Thbs2Q03350 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Thbs2Q03350 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Thbs2Q03350 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Thbs2Q03350 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Thbs2Q03350 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Thbs2Q03350 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Thbs2Q03350 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Thbs2Q03350 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Thbs2Q03350 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Thbs2Q03350 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Thbs2Q03350 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Thbs2Q03350 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Thbs2Q03350 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Thbs2Q03350 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Thbs2Q03350 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Thbs2Q03350 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Thbs2Q03350 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Thbs2Q03350 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Thbs2Q03350 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Thbs2Q03350 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Thbs2Q03350 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Thbs2Q03350 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Thbs2Q03350 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Thbs2Q03350 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Thbs2Q03350 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Thbs2Q03350 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Thbs2Q03350 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Thbs2Q03350 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Thbs2Q03350 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Thbs2Q03350 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Thbs2Q03350 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Thbs2Q03350 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Thbs2Q03350 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Thbs2Q03350 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Thbs2Q03350 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Thbs2Q03350 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Thbs2Q03350 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Thbs2Q03350 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Thbs2Q03350 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Thbs2Q03350 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Thbs2Q03350 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Thbs2Q03350 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Thbs2Q03350 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Thbs2Q03350 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Thbs2Q03350 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Thbs2Q03350 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Thbs2Q03350 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Thbs2Q03350 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Thbs2Q03350 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Thbs2Q03350 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Thbs2Q03350 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Thbs2Q03350 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Thbs2Q03350 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Thbs2Q03350 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Thbs2Q03350 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Thbs2Q03350 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
Thbs2Q03350 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Thbs2Q03350 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Thbs2Q03350 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Thbs2Q03350 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Thbs2Q03350 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Thbs2Q03350 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Thbs2Q03350 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Thbs2Q03350 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Thbs2Q03350 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Thbs2Q03350 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Thbs2Q03350 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Thbs2Q03350 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms