Protein–RNA interactions for Protein: Q03157

Aplp1, Amyloid-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aplp1Q03157 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Aplp1Q03157 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Aplp1Q03157 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Aplp1Q03157 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Aplp1Q03157 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Aplp1Q03157 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Aplp1Q03157 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Aplp1Q03157 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Aplp1Q03157 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Aplp1Q03157 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Aplp1Q03157 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Aplp1Q03157 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Aplp1Q03157 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Aplp1Q03157 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Aplp1Q03157 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Aplp1Q03157 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Aplp1Q03157 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Aplp1Q03157 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Aplp1Q03157 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Aplp1Q03157 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Aplp1Q03157 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Aplp1Q03157 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Aplp1Q03157 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Aplp1Q03157 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Aplp1Q03157 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Aplp1Q03157 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Aplp1Q03157 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Aplp1Q03157 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Aplp1Q03157 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Aplp1Q03157 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Aplp1Q03157 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Aplp1Q03157 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Aplp1Q03157 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Aplp1Q03157 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Aplp1Q03157 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Aplp1Q03157 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Aplp1Q03157 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Aplp1Q03157 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Aplp1Q03157 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Aplp1Q03157 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Aplp1Q03157 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Aplp1Q03157 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Aplp1Q03157 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Aplp1Q03157 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Aplp1Q03157 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Aplp1Q03157 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Aplp1Q03157 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Aplp1Q03157 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Aplp1Q03157 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Aplp1Q03157 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Aplp1Q03157 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Aplp1Q03157 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Aplp1Q03157 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Aplp1Q03157 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Aplp1Q03157 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Aplp1Q03157 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Aplp1Q03157 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Aplp1Q03157 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Aplp1Q03157 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Aplp1Q03157 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Aplp1Q03157 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Aplp1Q03157 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Aplp1Q03157 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Aplp1Q03157 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Aplp1Q03157 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Aplp1Q03157 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Aplp1Q03157 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Aplp1Q03157 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Aplp1Q03157 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Aplp1Q03157 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Aplp1Q03157 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Aplp1Q03157 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Aplp1Q03157 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Aplp1Q03157 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Aplp1Q03157 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Aplp1Q03157 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Aplp1Q03157 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Aplp1Q03157 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Aplp1Q03157 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Aplp1Q03157 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Aplp1Q03157 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Aplp1Q03157 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Aplp1Q03157 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Aplp1Q03157 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Aplp1Q03157 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Aplp1Q03157 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Aplp1Q03157 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Aplp1Q03157 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Aplp1Q03157 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Aplp1Q03157 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Aplp1Q03157 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Aplp1Q03157 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Aplp1Q03157 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Aplp1Q03157 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Aplp1Q03157 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Aplp1Q03157 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Aplp1Q03157 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Aplp1Q03157 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Aplp1Q03157 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Aplp1Q03157 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms