Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PrkcqQ02111 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PrkcqQ02111 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PrkcqQ02111 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PrkcqQ02111 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PrkcqQ02111 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PrkcqQ02111 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PrkcqQ02111 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PrkcqQ02111 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PrkcqQ02111 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PrkcqQ02111 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PrkcqQ02111 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrkcqQ02111 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrkcqQ02111 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PrkcqQ02111 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PrkcqQ02111 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PrkcqQ02111 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PrkcqQ02111 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PrkcqQ02111 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PrkcqQ02111 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PrkcqQ02111 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PrkcqQ02111 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PrkcqQ02111 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PrkcqQ02111 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PrkcqQ02111 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PrkcqQ02111 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PrkcqQ02111 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PrkcqQ02111 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PrkcqQ02111 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PrkcqQ02111 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PrkcqQ02111 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PrkcqQ02111 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PrkcqQ02111 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PrkcqQ02111 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PrkcqQ02111 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PrkcqQ02111 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PrkcqQ02111 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PrkcqQ02111 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PrkcqQ02111 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PrkcqQ02111 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PrkcqQ02111 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PrkcqQ02111 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PrkcqQ02111 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PrkcqQ02111 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PrkcqQ02111 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PrkcqQ02111 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PrkcqQ02111 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PrkcqQ02111 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PrkcqQ02111 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PrkcqQ02111 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PrkcqQ02111 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PrkcqQ02111 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PrkcqQ02111 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PrkcqQ02111 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PrkcqQ02111 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PrkcqQ02111 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PrkcqQ02111 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PrkcqQ02111 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PrkcqQ02111 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PrkcqQ02111 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PrkcqQ02111 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PrkcqQ02111 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PrkcqQ02111 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PrkcqQ02111 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PrkcqQ02111 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PrkcqQ02111 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PrkcqQ02111 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PrkcqQ02111 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PrkcqQ02111 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PrkcqQ02111 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PrkcqQ02111 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrkcqQ02111 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrkcqQ02111 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrkcqQ02111 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrkcqQ02111 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrkcqQ02111 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PrkcqQ02111 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PrkcqQ02111 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PrkcqQ02111 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PrkcqQ02111 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PrkcqQ02111 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PrkcqQ02111 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PrkcqQ02111 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PrkcqQ02111 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PrkcqQ02111 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PrkcqQ02111 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PrkcqQ02111 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PrkcqQ02111 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PrkcqQ02111 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PrkcqQ02111 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PrkcqQ02111 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PrkcqQ02111 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrkcqQ02111 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrkcqQ02111 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrkcqQ02111 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrkcqQ02111 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PrkcqQ02111 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PrkcqQ02111 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PrkcqQ02111 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrkcqQ02111 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms