Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ascl1Q02067 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ascl1Q02067 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ascl1Q02067 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ascl1Q02067 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ascl1Q02067 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ascl1Q02067 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ascl1Q02067 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ascl1Q02067 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ascl1Q02067 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ascl1Q02067 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ascl1Q02067 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ascl1Q02067 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ascl1Q02067 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ascl1Q02067 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ascl1Q02067 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ascl1Q02067 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ascl1Q02067 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ascl1Q02067 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ascl1Q02067 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ascl1Q02067 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ascl1Q02067 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ascl1Q02067 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ascl1Q02067 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ascl1Q02067 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ascl1Q02067 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ascl1Q02067 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ascl1Q02067 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ascl1Q02067 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ascl1Q02067 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ascl1Q02067 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ascl1Q02067 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ascl1Q02067 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ascl1Q02067 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ascl1Q02067 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ascl1Q02067 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ascl1Q02067 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ascl1Q02067 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ascl1Q02067 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ascl1Q02067 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ascl1Q02067 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ascl1Q02067 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ascl1Q02067 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ascl1Q02067 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ascl1Q02067 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ascl1Q02067 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ascl1Q02067 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ascl1Q02067 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ascl1Q02067 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ascl1Q02067 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ascl1Q02067 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ascl1Q02067 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ascl1Q02067 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ascl1Q02067 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ascl1Q02067 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ascl1Q02067 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ascl1Q02067 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ascl1Q02067 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ascl1Q02067 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ascl1Q02067 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ascl1Q02067 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ascl1Q02067 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ascl1Q02067 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ascl1Q02067 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ascl1Q02067 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ascl1Q02067 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ascl1Q02067 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ascl1Q02067 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ascl1Q02067 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ascl1Q02067 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ascl1Q02067 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ascl1Q02067 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ascl1Q02067 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ascl1Q02067 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ascl1Q02067 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ascl1Q02067 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ascl1Q02067 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ascl1Q02067 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ascl1Q02067 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ascl1Q02067 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ascl1Q02067 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ascl1Q02067 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ascl1Q02067 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ascl1Q02067 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ascl1Q02067 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ascl1Q02067 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ascl1Q02067 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ascl1Q02067 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ascl1Q02067 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ascl1Q02067 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ascl1Q02067 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ascl1Q02067 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ascl1Q02067 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ascl1Q02067 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ascl1Q02067 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ascl1Q02067 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ascl1Q02067 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ascl1Q02067 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ascl1Q02067 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ascl1Q02067 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms