Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sec23aQ01405 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sec23aQ01405 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sec23aQ01405 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Sec23aQ01405 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sec23aQ01405 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sec23aQ01405 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Sec23aQ01405 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sec23aQ01405 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sec23aQ01405 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sec23aQ01405 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sec23aQ01405 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sec23aQ01405 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sec23aQ01405 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Sec23aQ01405 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Sec23aQ01405 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sec23aQ01405 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sec23aQ01405 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sec23aQ01405 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sec23aQ01405 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sec23aQ01405 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sec23aQ01405 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sec23aQ01405 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sec23aQ01405 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sec23aQ01405 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sec23aQ01405 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sec23aQ01405 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sec23aQ01405 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sec23aQ01405 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sec23aQ01405 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sec23aQ01405 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sec23aQ01405 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sec23aQ01405 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Sec23aQ01405 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Sec23aQ01405 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sec23aQ01405 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sec23aQ01405 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sec23aQ01405 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sec23aQ01405 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sec23aQ01405 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sec23aQ01405 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sec23aQ01405 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sec23aQ01405 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sec23aQ01405 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sec23aQ01405 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sec23aQ01405 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sec23aQ01405 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sec23aQ01405 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sec23aQ01405 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sec23aQ01405 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sec23aQ01405 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sec23aQ01405 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sec23aQ01405 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sec23aQ01405 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sec23aQ01405 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sec23aQ01405 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sec23aQ01405 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Sec23aQ01405 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sec23aQ01405 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sec23aQ01405 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sec23aQ01405 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sec23aQ01405 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sec23aQ01405 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sec23aQ01405 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sec23aQ01405 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sec23aQ01405 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sec23aQ01405 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sec23aQ01405 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sec23aQ01405 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sec23aQ01405 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sec23aQ01405 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sec23aQ01405 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sec23aQ01405 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sec23aQ01405 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sec23aQ01405 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sec23aQ01405 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sec23aQ01405 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sec23aQ01405 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sec23aQ01405 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sec23aQ01405 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sec23aQ01405 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sec23aQ01405 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sec23aQ01405 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sec23aQ01405 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sec23aQ01405 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sec23aQ01405 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sec23aQ01405 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sec23aQ01405 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sec23aQ01405 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sec23aQ01405 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sec23aQ01405 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sec23aQ01405 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sec23aQ01405 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Sec23aQ01405 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sec23aQ01405 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sec23aQ01405 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sec23aQ01405 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Sec23aQ01405 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Sec23aQ01405 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sec23aQ01405 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms